Basic Information

Symbol
FOSL1
RNA class
mRNA
Alias
FOS Like 1, AP-1 Transcription Factor Subunit Fra-1 Fos-Related Antigen 1 FRA1 FOS Like 1, AP-1 Trancription Factor Subunit FOS Like Antigen 1 FOS-Like Antigen-1 FRA-1 FRA
Location (GRCh38)
11:65892049-65900573
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005438.5
Sequence length
1702.0 nt
GC content
0.5870

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-595.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -624.11 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 450.06
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001300844.2 NCBI
GAGUCAGAACCCAGCAGCCGUGUACCCCGCAGAGCCGCCAGCCCCGGGC… 1594 nt 0.5822
NM_001300855.2 NCBI
GAGUCAGAACCCAGCAGCCGUGUACCCCGCAGAGCCGCCAGCCCCGGGC… 1697 nt 0.5875
NM_001300856.2 NCBI
GAGUCAGAACCCAGCAGCCGUGUACCCCGCAGAGCCGCCAGCCCCGGGC… 1504 nt 0.5818
NM_001300857.2 NCBI
GAGUCAGAACCCAGCAGCCGUGUACCCCGCAGAGCCGCCAGCCCCGGGC… 1396 nt 0.5759
NM_005438.5 NCBI
GAGUCAGAACCCAGCAGCCGUGUACCCCGCAGAGCCGCCAGCCCCGGGC… 1702 nt 0.5870
Summary

The Fos gene family consists of 4 members: FOS, FOSB, FOSL1, and FOSL2. These genes encode leucine zipper proteins that can dimerize with proteins of the JUN family, thereby forming the transcription factor complex AP-1. As such, the FOS proteins have been implicated as regulators of cell proliferation, differentiation, and transformation. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2014]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the FOSL1 protein exhibits time-sensitive expression in contused skeletal muscle, with significant increases observed at 4, 8, and 32-48 hours post-injury, while showing no significant change in contralateral uninjured muscle or in post-mortem specimens for up to 24 hours [Sun et al. DOI:10.1080/00450618.2017.1334824]. In human skin, the FOSL1 was identified as a critical driver of keratinocyte migration during acute wound healing, with its expression transiently upregulated at wound edges and its silencing significantly reducing keratinocyte motility [Liu et al. DOI:10.1016/j.stem.2024.11.013]. In a separate study investigating UVB-induced inflammatory pain in humans and rats, the FOSL1 was found to be up-regulated in skin, with a fold change of 93.1 in human and 10.9 in rat skin, indicating its role in the cellular stress response to this inflammatory stimulus [Dawes et al. DOI:10.1371/journal.pone.0093338].