Basic Information

Symbol
FOXC2
RNA class
mRNA
Alias
Forkhead Box C2 FKHL14 MFH-1 Forkhead Box C2 (MFH-1, Mesenchyme Forkhead 1) Forkhead-Related Protein FKHL14 Mesenchyme Fork Head Protein 1 Transcription Factor FKH-14 Forkhead Box Protein C2 Mesenchyme Forkhead 1 MFH1 Forkhead, Drosophila, Homolog-Like 14 MFH-1,Mesenchyme Forkhead 1 MFH-1 Protein LD
Location (GRCh38)
16:86566829-86569728
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005251.3
Sequence length
2900.0 nt
GC content
0.6317

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1226.97 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1272.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 631.79
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_005251.3 NCBI
GAAACUUUUCCCAAUCCCUAAAAGGGACUUGGCCUCUUUUUCUGGGCUC… 2900 nt 0.6317
Summary

This gene belongs to the forkhead family of transcription factors which is characterized by a distinct DNA-binding forkhead domain. The specific function of this gene has not yet been determined; however, it may play a role in the development of mesenchymal tissues. [provided by RefSeq, Jul 2008] CIViC Summary for FOXC2 Gene

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the mRNA expression of the FOXC2, a factor involved in lymphangiogenesis and angiogenesis, showed a statistically significant decrease at 1 and 3 days following dorsal skin incision wounds [Kameyama et al. DOI:10.1016/J.Legalmed.2015.02.007].