Basic Information

Symbol
FOXD1
RNA class
mRNA
Alias
Forkhead Box D1 FREAC4 FKHL8 Forkhead-Related Transcription Factor 4 Forkhead-Related Protein FKHL8 Forkhead Box Protein D1 FREAC-4 Forkhead, Drosophila, Homolog-Like 8 Forkhead-Related Activator 4 Forkhead-Like 8
Location (GRCh38)
5:73444827-73448777
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004472.3
Sequence length
2512.0 nt
GC content
0.6664

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1231.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1272.45 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 732.66
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_004472.3 NCBI
GGACUCAGCCCUGGCCUCGCCGAGCUCUGUUCUUAGACUCUCACCCGUC… 2512 nt 0.6664
Summary

This gene belongs to the forkhead family of transcription factors which are characterized by a distinct forkhead domain. Studies of the orthologous mouse protein indicate that it functions in kidney development by promoting nephron progenitor differentiation, and it also functions in the development of the retina and optic chiasm. It may also regulate inflammatory reactions and prevent autoimmunity. [provided by RefSeq, Apr 2014]

Forensic Context

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