Basic Information

Symbol
FOXD4L6
RNA class
mRNA
Alias
Forkhead Box D4 Like 6 Forkhead Box Protein D4-Like 6 OTTHUMG00000066822 FOXD4-Like 6
Location (GRCh38)
9:41126435-41128681
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001085476.4
Sequence length
2247.0 nt
GC content
0.5883

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-880.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -917.69 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 493.54
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001085476.4 NCBI
GAAGACCAUCAUCCCUGGACUACGUUAGGAGGAAGUGGCACCGCUCCGA… 2247 nt 0.5883
Summary

Predicted to enable DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific and RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding activity. Predicted to be involved in anatomical structure morphogenesis; cell differentiation; and regulation of transcription by RNA polymerase II. Predicted to be located in chromatin. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans identified FOXD4L6 as a key hub gene within a protein-protein interaction network constructed from differentially expressed mRNAs in the ceRNA regulatory network of septic acute kidney injury, based on RNA-seq analysis of whole blood from patients and healthy controls [Ma et al. DOI:10.3389/fgene.2023.1209042].