Basic Information

Symbol
FOXE1
RNA class
mRNA
Alias
Forkhead Box E1 TTF-2 HFKH4 Thyroid Transcription Factor 2 FKHL15 FOXE2 TITF2 Forkhead-Related Protein FKHL15 HNF-3/Fork Head-Like Protein 5 Forkhead Box Protein E1 Forkhead Box Protein E2 HFKL5 TTF2 Forkhead Box E1 (Thyroid Transcription Factor 2) Forkhead, Drosophila, Homolog-Like 15 Forkhead Box E2 BAMLAZ NMTC4
Location (GRCh38)
9:97853226-97856717
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004473.4
Sequence length
3492.0 nt
GC content
0.6105

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1448.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1509.38 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 751.03
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_004473.4 NCBI
GAGCCGGUCCGGUGUGUGCAGGGGAGCGCCUCGCCAGCGGUCCGCAGGG… 3492 nt 0.6105
Summary

This intronless gene encodes a protein that belongs to the forkhead family of transcription factors. Members of this family contain a conserved 100-amino acid DNA-binding 'forkhead' domain. The encoded protein functions as a thyroid transcription factor that plays a role in thyroid morphogenesis. Mutations in this gene are associated with the Bamforth-Lazarus syndrome, and with susceptibility to nonmedullary thyroid cancer-4. [provided by RefSeq, Nov 2016]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.