Basic Information

Symbol
FOXJ2
RNA class
mRNA
Alias
Forkhead Box J2 FHX Forkhead Box Protein J2 Fork Head Homologous X FOXJ2 Forkhead Factor
Location (GRCh38)
12:8032698-8055522
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018416.3
Sequence length
5524.0 nt
GC content
0.5129

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1916.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2016.55 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1356.74
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_018416.3 NCBI
GCAGCGGAGCCGAGCCGAGCCCGAGCCCGCGCCGAGCCCUGACACUGUC… 5524 nt 0.5129
Summary

Enables DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding activity; and identical protein binding activity. Involved in several processes, including negative regulation of angiogenesis; negative regulation of blood vessel endothelial cell differentiation; and positive regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation. Located in fibrillar center and nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

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