Basic Information

Symbol
FOXK2
RNA class
mRNA
Alias
Forkhead Box K2 ILF1 ILF G/T-Mismatch Specific Binding Protein Interleukin Enhancer-Binding Factor 1 Forkhead Box Protein K2 NGTBP Interleukin Enhancer Binding Factor 1 Cellular Transcription Factor ILF-1 ILF-1 FOXK1
Location (GRCh38)
17:82519689-82644662
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004514.4
Sequence length
5243.0 nt
GC content
0.5556

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1979.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2067.66 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1431.71
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_004514.4 NCBI
GCCCCUCGCCGCCGCUCGCUCGCUCGCCGGCCGGCGGCCUCCGCUCGGC… 5243 nt 0.5556
Summary

The protein encoded by this gene contains a fork head DNA binding domain. This protein can bind to the purine-rich motifs of the HIV long terminal repeat (LTR), and to the similar purine-rich motif in the interleukin 2 (IL2) promoter. It may be involved in the regulation of viral and cellular promoter elements. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans using integrated bulk and single-cell RNA sequencing identified six hub genes, including the FOXK2, as diagnostic biomarkers for sepsis, with its expression significantly lower in sepsis samples compared to controls in both training and testing datasets [Ye et al. DOI:10.1002/gch2.202400321].