Basic Information

Symbol
FOXO4
RNA class
mRNA
Alias
Forkhead Box O4 AFX1 MLLT7 Myeloid/Lymphoid Or Mixed-Lineage Leukemia (Trithorax Homolog, Drosophila); Translocated To, 7 Fork Head Domain Transcription Factor AFX1 Forkhead Box Protein O4 AFX Myeloid/Lymphoid Or Mixed-Lineage Leukemia (Trithorax (Drosophila) Homolog); Translocated To, 7
Location (GRCh38)
X:71095851-71103535
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis Chronological age estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005938.4
Sequence length
3644.0 nt
GC content
0.5692

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1480.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1548.20 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 850.83
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001170931.2 NCBI
GCAGAUGGCUGCCCCGGCGAGUGGUAAACAGAGACGUCAGGAGGGGGCU… 3479 nt 0.5648
NM_005938.4 NCBI
GCAGAUGGCUGCCCCGGCGAGUGGUAAACAGAGACGUCAGGAGGGGGCU… 3644 nt 0.5692
Summary

This gene encodes a member of the O class of winged helix/forkhead transcription factor family. Proteins encoded by this class are regulated by factors involved in growth and differentiation indicating they play a role in these processes. A translocation involving this gene on chromosome X and the homolog of the Drosophila trithorax gene, encoding a DNA binding protein, located on chromosome 11 is associated with leukemia. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2010]

Forensic Context

A study in older monozygotic twins demonstrated that the FOXO4 is a target of miR-1274a, a circulating microRNA negatively associated with activity of daily living endurance scores in both cross-sectional and longitudinal analyses, indicating its role in age-related functional decline [La Grotta et al. DOI:10.1016/j.mad.2025.112099]. In human sepsis research, single-cell RNA-seq analysis of peripheral blood mononuclear cells revealed that the FOXO4 transcription factor exhibited enhanced activity in plasma cells with high propionate metabolism, identifying it as part of a regulatory network associated with sepsis pathophysiology [Yang et al. DOI:10.1038/s41598-025-06463-2].