Basic Information

Symbol
FOXO6
RNA class
mRNA
Alias
Forkhead Box O6 Forkhead Box Protein O6
Location (GRCh38)
1:41361922-41383590
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001291281.3
Sequence length
3086.0 nt
GC content
0.7259

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1608.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1658.95 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 677.77
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001291281.3 NCBI
GAGGUGCAGCCGGCGCUGAGCGCGGCAGGCGCGGGAGCUGGCGCUGGAG… 3086 nt 0.7259
Summary

Predicted to enable DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific and RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding activity. Predicted to be involved in positive regulation of dendritic spine development and regulation of transcription by RNA polymerase II. Predicted to be located in chromatin and cytoplasm. Predicted to be active in nucleus. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans analyzing leukocyte gene expression profiles from severe burn patients identified the FOXO6 as a transcription factor with sustained increased expression post-burn, suggesting it may be a driver for inducing an immunosuppressive state during recovery [Xu et al. DOI:10.1159/000493451].