Basic Information

Symbol
FOXP2
RNA class
mRNA
Alias
Forkhead Box P2 CAGH44 CAG Repeat Protein 44 TNRC10 Trinucleotide Repeat-Containing Gene 10 Protein Forkhead/Winged-Helix Transcription Factor Trinucleotide Repeat Containing 10 Forkhead Box Protein P2 SPCH1 Speech And Language Disorder 1
Location (GRCh38)
7:114086317-114693772
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014491.4
Sequence length
6543.0 nt
GC content
0.3940

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1637.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1763.19 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1506.84
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001172766.3 NCBI
ACAGACAUGAAAGCUAACCGAGGACUUGAGAGACUCAAACUGGUGCUUU… 6540 nt 0.3939
NM_001172767.2 NCBI
GUAUUAAGUCAUGAUGCAGGAAUCUGCGACAGAGACAAUAAGCAACAGU… 1485 nt 0.4707
NM_014491.4 NCBI
ACAGACAUGAAAGCUAACCGAGGACUUGAGAGACUCAAACUGGUGCUUU… 6543 nt 0.3940
NM_148898.4 NCBI
ACAGACAUGAAAGCUAACCGAGGACUUGAGAGACUCAAACUGGUGCUUU… 6618 nt 0.3944
NM_148899.3 NCBI
GUAUUAAGUCAUGAUGCAGGAAUCUGCGACAGAGACAAUAAGCAACAGU… 1410 nt 0.4730
NM_148900.4 NCBI
ACAGACAUGAAAGCUAACCGAGGACUUGAGAGACUCAAACUGGUGCUUU… 6594 nt 0.3935
Summary

This gene encodes a member of the forkhead/winged-helix (FOX) family of transcription factors. It is expressed in fetal and adult brain as well as in several other organs such as the lung and gut. The protein product contains a FOX DNA-binding domain and a large polyglutamine tract and is an evolutionarily conserved transcription factor, which may bind directly to approximately 300 to 400 gene promoters in the human genome to regulate the expression of a variety of genes. This gene is required for proper development of speech and language regions of the brain during embryogenesis, and may be involved in a variety of biological pathways and cascades that may ultimately influence language development. Mutations in this gene cause speech-language disorder 1 (SPCH1), also known as autosomal dominant speech and language disorder with orofacial dyspraxia. Multiple alternative transcripts encoding different isoforms have been identified in this gene.[provided by RefSeq, Feb 2010]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.