Basic Information

Symbol
FOXS1
RNA class
mRNA
Alias
Forkhead Box S1 FREAC10 FKHL18 Forkhead-Related Transcription Factor 10 Forkhead-Like 18 Protein Forkhead Box Protein S1 FREAC-10 Forkhead-Related Transcription Factor FREAC-10 Forkhead (Drosophila)-Like 18 Forkhead-Like 18 (Drosophila) Forkhead-Related Activator 10
Location (GRCh38)
20:31844303-31845604
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004118.4
Sequence length
1302.0 nt
GC content
0.6413

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-537.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -556.57 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 472.71
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_004118.4 NCBI
ACGCCAGCCCUGGAAGCUGAGCCUGACCCAGCAGGUCCCAGCAGCCUGG… 1302 nt 0.6413
Summary

The forkhead family of transcription factors belongs to the winged helix class of DNA-binding proteins. The protein encoded by this intronless gene contains a forkhead domain and is found predominantly in aorta and kidney. The function of the encoded protein is unknown. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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