Basic Information

Symbol
AKR7A2
RNA class
mRNA
Alias
Aldo-Keto Reductase Family 7 Member A2 AFAR Aflatoxin B1 Aldehyde Reductase Member 2 Succinic Semialdehyde Reductase Aflatoxin Aldehyde Reductase AFB1 Aldehyde Reductase 1 Aldoketoreductase 7 SSA Reductase AFB1-AR 1 AFAR1 AKR7 Epididymis Secretory Sperm Binding Protein Li 166mP Aflatoxin Beta1 Aldehyde Reductase EC 1.1.1.N11 HEL-S-166mP AFB1-AR1
Location (GRCh38)
1:19301991-19312144
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003689.4
Sequence length
1360.0 nt
GC content
0.6103

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-572.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -593.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 264.68
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001320979.1 NCBI
CCAACGCGCAGGCGCCGCUGCUAUGCUGAGUGCCGCGUCUCGCGUAGUC… 2514 nt 0.5501
NM_003689.4 NCBI
AACGCGCAGGCGCCGCUGCUAUGCUGAGUGCCGCGUCUCGCGUAGUCUC… 1360 nt 0.6103
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the aldo/keto reductase (AKR) superfamily and AKR7 family, which are involved in the detoxification of aldehydes and ketones. The AKR7 family consists of 3 genes that are present in a cluster on the p arm of chromosome 1. This protein, thought to be localized in the golgi, catalyzes the NADPH-dependent reduction of succinic semialdehyde to the endogenous neuromodulator, gamma-hydroxybutyrate. It may also function as a detoxication enzyme in the reduction of aflatoxin B1 and 2-carboxybenzaldehyde. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Mar 2016]

Forensic Context

A pilot study in humans investigated the AKR7A2 as a potential biomarker for gamma-hydroxybutyric acid (GHB) intake via qPCR analysis of blood samples from three patients therapeutically taking GHB and 49 control donors [Mehling et al. DOI:10.1007/S00414-017-1609-3].