Basic Information

Symbol
FREM3
RNA class
mRNA
Alias
FRAS1 Related Extracellular Matrix 3 FRAS1-Related Extracellular Matrix Protein 3
Location (GRCh38)
4:143577302-143700675
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis Tissue/body fluid identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001168235.2
Sequence length
6729.0 nt
GC content
0.5044

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2255.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2380.30 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1587.17
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001168235.2 NCBI
AUGGCGGGGGCUUCUCGGCACCCGACUGGGACGCCCCGGCAGCUCCUUG… 6729 nt 0.5044
Summary

This gene encodes an integral membrane protein containing numerous CSPG (chondroitin sulfate proteoglycan element) repeats and Calx-beta domains. The protein belongs to the family of FRAS1/FREM extracellular matrix proteins and may play a role cell adhesion. [provided by RefSeq, Feb 2017]

Forensic Context

A study in humans identified the FREM3 as a potential diagnostic and severity biomarker for chemical injuries by mustard gas, with its expression levels showing significant differences among severity groups in peripheral blood mononuclear cells [Arabfard et al. DOI:10.1016/j.intimp.2025.114090]. A separate review highlighted the FREM3 as a laminar marker (L3) in the human dorsolateral prefrontal cortex for spatial transcriptomics, indicating its application in forensic studies for analyzing spatial heterogeneities in tissue [Yang et al. DOI:10.1007/s00414-022-02889-9].