Basic Information

Symbol
FRMD3
RNA class
mRNA
Alias
FERM Domain Containing 3 EPB41L4O FERM Domain-Containing Protein 3 Band 4.1-Like Protein 4O Ovary Type Protein 4.1 MGC20553 4.1O Band 4.1-Like Protein 4 Protein 4.1O EPB41LO P410
Location (GRCh38)
9:83242990-83538737
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_174938.6
Sequence length
5260.0 nt
GC content
0.4042

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1500.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1603.41 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1312.87
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001244959.2 NCBI
GCCGCGCCCCGGCCGCUGGGCAUGUGUGUCCGCAGGCGCCCGACGCUGC… 2051 nt 0.5100
NM_001244960.2 NCBI
AGCCCUAGAGCUCCCAGAGACAGAAGACGAGAUGGCAGUAUUUUAAGGC… 5068 nt 0.3883
NM_001244961.2 NCBI
GCUUCAUUUCGGAAGUGAUUCAUAGCACUUCUGCUUACAACUCUCUGAU… 1395 nt 0.4867
NM_001244962.2 NCBI
GCAUUAGGAACCUGACAUUUGAUUCAUUCAGUGGGUCCUGCCUAGGUCC… 943 nt 0.5111
NM_001375487.1 NCBI
GCAUUAGGAACCUGACAUUUGAUUCAUUCAGUGGGUCCUGCCUAGGUCC… 4152 nt 0.3762
NM_174938.6 NCBI
GCCGCGCCCCGGCCGCUGGGCAUGUGUGUCCGCAGGCGCCCGACGCUGC… 5260 nt 0.4042
Summary

The protein encoded by this gene is a single pass membrane protein primarily found in ovaries. A similar protein in erythrocytes helps determine the shape of red blood cells, but the function of the encoded protein has not been determined. There is some evidence that this is a tumor suppressor gene, and there is also evidence linking defects in this gene to susceptibility to diabetic nephropathy in type 1 diabetes. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2011]

Forensic Context

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