Basic Information

Symbol
FRS2
RNA class
mRNA
Alias
Fibroblast Growth Factor Receptor Substrate 2 SNT-1 FRS2alpha FRS2A SNT1 Suc1-Associated Neurotrophic Factor Target 1 FGFR-Signaling Adaptor SNT FGFR Substrate 2 Epididymis Secretory Sperm Binding Protein FGFR Signalling Adaptor FRS1A SNT
Location (GRCh38)
12:69470349-69579793
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden death from CNS diseases Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001278356.2
Sequence length
6768.0 nt
GC content
0.3692

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1695.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1834.29 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1620.20
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001042555.3 NCBI
CAAGAUUCGGGCCGGAGAGAGGCCUUGUAGGCACAGCGGCUGAGACUCG… 6829 nt 0.3695
NM_001278351.2 NCBI
CAAGAUUCGGGCCGGAGAGAGGCCUUGUAGGCACAGCGGCUGAGACUCG… 6950 nt 0.3722
NM_001278353.2 NCBI
CAAGAUUCGGGCCGGAGAGAGGCCUUGUAGGCACAGCGGCUGAGACUCG… 6893 nt 0.3695
NM_001278354.2 NCBI
CAAGAUUCGGGCCGGAGAGAGGCCUUGUAGGCACAGCGGCUGAGACUCG… 6882 nt 0.3720
NM_001278355.2 NCBI
CAAGAUUCGGGCCGGAGAGAGGCCUUGUAGGCACAGCGGCUGAGACUCG… 6864 nt 0.3702
NM_001278356.2 NCBI
CAAGAUUCGGGCCGGAGAGAGGCCUUGUAGGCACAGCGGCUGAGACUCG… 6768 nt 0.3692
NM_001278357.2 NCBI
CAAGAUUCGGGCCGGAGAGAGGCCUUGUAGGCACAGCGGCUGAGACUCG… 6629 nt 0.3690
NM_006654.5 NCBI
CAAGAUUCGGGCCGGAGAGAGGCCUUGUAGGCACAGCGGCUGAGACUCG… 6836 nt 0.3695
Summary

Enables fibroblast growth factor receptor binding activity and neurotrophin TRKA receptor binding activity. Involved in negative regulation of cardiac muscle cell differentiation. Acts upstream of or within fibroblast growth factor receptor signaling pathway. Located in adherens junction. Biomarker of renal cell carcinoma. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A bioinformatics study in adult female Wistar rats (Rattus norvegicus) identified 68 time-course differentially expressed microRNAs after spinal cord injury, with synergetic analysis revealing 193 co-regulated target genes enriched in nervous system development [Liu et al. DOI:10.1097/BRS.0000000000001323].