Basic Information

Symbol
FSIP2
RNA class
mRNA
Alias
Fibrous Sheath Interacting Protein 2 Fibrous Sheath-Interacting Protein 2 FLJ34780 SPGF34
Location (GRCh38)
2:185738804-185833290
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Forensic psychiatry evaluation Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_173651.4
Sequence length
20879.0 nt
GC content
0.3493

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-4664.71 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -5085.88 kcal/mol
Frequency: 1.64992e-297
Diversity: 4626.37
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_173651.4 NCBI
AUUCCUGGUCAGGUCCGGACAGAGGGACAACGGGGUGCUAGAGAAGGAG… 20879 nt 0.3493
Summary

This gene encodes a protein associated with the sperm fibrous sheath. Genes encoding most of the fibrous-sheath associated proteins genes are transcribed only during the postmeiotic period of spermatogenesis. The protein encoded by this gene is specific to spermatogenic cells. Copy number variation in this gene may be associated with testicular germ cell tumors. Pseudogenes associated with this gene are reported on chromosomes 2 and X. [provided by RefSeq, Aug 2016]

Forensic Context

A study in human postmortem brain tissue from individuals with alcohol use disorder (AUD) demonstrated that the mRNA for FSIP2 was upregulated in the caudate nucleus, nucleus accumbens, prefrontal cortex, and putamen [Lim et al. DOI:10.1038/s41398-021-01635-w].