Basic Information

Symbol
FTSJ1
RNA class
mRNA
Alias
FtsJ RNA 2''-O-Methyltransferase 1 FtsJ RNA 2'-O-Methyltransferase 1 CDLIV TRMT7 JM23 SPB1 TRNA (Cytidine(32)/Guanosine(34)-2'-O)-Methyltransferase 2'-O-Ribose RNA Methyltransferase TRM7 Homolog FtsJ RNA Methyltransferase Homolog 1 MRX44 TRM7 MRX9 Putative TRNA (Cytidine(32)/Guanosine(34)-2'-O)-Methyltransferase TRNA Methyltransferase 7 Homolog (S. Cerevisiae) FtsJ RNA Methyltransferase Homolog 1 (E. Coli) Putative Ribosomal RNA Methyltransferase 1 RRNA (Uridine-2'-O-)-Methyltransferase TRNA Methyltransferase 7 Homolog Mental Retardation, X-Linked 44 Mental Retardation, X-Linked 9 Protein FtsJ Homolog 1 Cell Division Protein FtsJ-Like Protein 1 EC 2.1.1.205 XLID9
Location (GRCh38)
X:48476021-48486364
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_012280.4
Sequence length
1899.0 nt
GC content
0.5245

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-643.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -679.02 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 603.30
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001282157.1 NCBI
AAAUCGAUCUUGGCCUCGGAAGAAAAAGAACAAAGAAUCGCUGGCAACU… 1669 nt 0.5159
NM_012280.4 NCBI
GUUCACAUCAGGUCCCGGCCCGCCGGAACCUGGGCGAUCCACGAUGCCG… 1899 nt 0.5245
NM_177439.3 NCBI
GUUCACAUCAGGUCCCGGCCCGCCGGAACCUGGGCGAUCCACGAUGCCG… 1999 nt 0.5303
Summary

This gene encodes a member of the methyltransferase superfamily. The encoded protein localizes to the nucleolus, binds to S-adenosylmethionine, and may be involved in the processing and modification of ribosomal RNA. Mutations in this gene are associated with cognitive disability. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Aug 2013]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.