Basic Information

Symbol
FUCA2
RNA class
mRNA
Alias
Alpha-L-Fucosidase 2 DJ20N2.5 Alpha-L-Fucoside Fucohydrolase 2 Fucosidase, Alpha-L- 2, Plasma Plasma Alpha-L-Fucosidase Plasma Fucosidase A-L-Fucosidase 2 EC 3.2.1.51 MGC1314 I+/--L-Fucosidase 2 Α-L-Fucosidase 2
Location (GRCh38)
6:143493961-143511842
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_032020.5
Sequence length
2385.0 nt
GC content
0.4419

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-725.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -766.65 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 558.04
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_032020.5 NCBI
GCGGCAUACUCAGCGGCAGAGACGGAAGAACAGCGCUCCCGAGGCCGCG… 2385 nt 0.4419
Summary

This gene encodes a plasma alpha-L-fucosidase, which represents 10-20% of the total cellular fucosidase activity. The protein is a member of the glycosyl hydrolase 29 family, and catalyzes the hydrolysis of the alpha-1,6-linked fucose joined to the reducing-end N-acetylglucosamine of the carbohydrate moieties of glycoproteins. This enzyme is essential for Helicobacter pylori adhesion to human gastric cancer cells. [provided by RefSeq, Aug 2010]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the FUCA2 gene, identified as an overlapping differentially expressed gene from a microarray study on proximal chromosome 10, was overexpressed in the methamphetamine high drinking (MAHDR) line compared to the low drinking (MALDR) line in the ventral midbrain [Hitzemann et al. DOI:10.3390/brainsci9070155].