Basic Information

Symbol
FUS
RNA class
mRNA
Alias
FUS RNA Binding Protein TLS HNRNPP2 FUS1 Heterogeneous Nuclear Ribonucleoprotein P2 Translocated In Liposarcoma Protein 75 KDa DNA-Pairing Protein RNA-Binding Protein FUS Fused In Sarcoma Oncogene FUS Oncogene TLS HnRNP-P2 ALS6 Fusion (Involved In T(12;16) In Malignant Liposarcoma) Fusion, Derived From T(12;16) Malignant Liposarcoma Fusion Gene In Myxoid Liposarcoma Amyotrophic Lateral Sclerosis 6 Translocated In Liposarcoma Fus-Like Protein POMP75 AltFUS POMp75 ETM4
Location (GRCh38)
16:31180134-31196963
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004960.4
Sequence length
1824.0 nt
GC content
0.5625

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-672.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -703.22 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 703.95
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001170634.1 NCBI
ACUUAAGCUUCGACGCAGGAGGCGGGGCUGCUCAGUCCUCCAGGCGUCG… 5116 nt 0.4975
NM_001170937.1 NCBI
ACUUAAGCUUCGACGCAGGAGGCGGGGCUGCUCAGUCCUCCAGGCGUCG… 5107 nt 0.4972
NM_004960.4 NCBI
GCUCAGUCCUCCAGGCGUCGGUACUCAGCGGUGUUGGAACUUCGUUGCU… 1824 nt 0.5625
Summary

This gene encodes a multifunctional protein component of the heterogeneous nuclear ribonucleoprotein (hnRNP) complex. The hnRNP complex is involved in pre-mRNA splicing and the export of fully processed mRNA to the cytoplasm. This protein belongs to the FET family of RNA-binding proteins which have been implicated in cellular processes that include regulation of gene expression, maintenance of genomic integrity and mRNA/microRNA processing. Alternative splicing results in multiple transcript variants. Defects in this gene result in amyotrophic lateral sclerosis type 6. [provided by RefSeq, Sep 2009]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.