Basic Information

Symbol
FYN
RNA class
mRNA
Alias
FYN Proto-Oncogene, Src Family Tyrosine Kinase SLK SYN FYN Oncogene Related To SRC, FGR, YES Tyrosine-Protein Kinase Fyn Proto-Oncogene C-Fyn Proto-Oncogene Syn Src-Like Kinase EC 2.7.10.2 MGC45350 OKT3-Induced Calcium Influx Regulator Tyrosine Kinase P59fyn(T) Src/Yes-Related Novel C-Syn Protooncogene EC 2.7.10 P59-FYN P59-Fyn
Location (GRCh38)
6:111660332-111873475
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002037.5
Sequence length
3628.0 nt
GC content
0.4843

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1149.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1218.04 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1076.11
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001370529.1 NCBI
ACAGCGGAGAGAAUAAUCGAAUGAAAACUGAAGCUUUCUGCUUUAUUCC… 3105 nt 0.4377
NM_002037.5 NCBI
AGAGCAUCAGCAAGAGUAGCAGCGAGCAGCCGCGCUGGUGGCGGCGGCG… 3628 nt 0.4843
NM_153047.4 NCBI
GGCUCCCGGGCCCGCCGGGGACCCCCCGGAGCCGCCUCGGCCGCGCCGG… 3238 nt 0.4472
NM_153048.4 NCBI
AGCGCAGGUCUGAGGAGCUGAGAAGGGAGGCUUACGUGAAGGGAAUUUA… 2909 nt 0.4366
Summary

This gene is a member of the protein-tyrosine kinase oncogene family. It encodes a membrane-associated tyrosine kinase that has been implicated in the control of cell growth. The protein associates with the p85 subunit of phosphatidylinositol 3-kinase and interacts with the fyn-binding protein. Alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms exist. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans identified the FYN as a top five upregulated long noncoding RNA in traumatic brain injury tissues, with its expression verified by qRT-PCR [Zhang et al. DOI:10.097/WNR.0000000000001756]. In a separate human study on severe burns, the FYN was identified via LASSO regression as having significant indigenous prognosis, though it was not included in the final four-gene logistic regression model [Zhang et al. DOI:10.3389/fgene.2022.908510].