Basic Information

Symbol
FZD1
RNA class
mRNA
Alias
Frizzled Class Receptor 1 Frizzled-1 Hfz1 Frizzled 1, Seven Transmembrane Spanning Receptor Frizzled, Drosophila, Homolog Of, 1 Frizzled Family Receptor 1 DKFZp564G072 Wnt Receptor Fz-1 FzE1 Frizzled (Drosophila) Homolog 1 Frizzled Homolog 1 (Drosophila) Frizzled Homolog 1 HFz1
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_003505.2
Sequence length
6894.0 nt
GC content
0.4762

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2380.80 kcal/mol
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
GGUCCGAGGGCGCGCGAGGCAGAGGAGAGGGAGCGAGUUGAGGGAUUGA… 6894 nt 0.4762
Summary

Members of the 'frizzled' gene family encode 7-transmembrane domain proteins that are receptors for Wnt signaling proteins. The FZD1 protein contains a signal peptide, a cysteine-rich domain in the N-terminal extracellular region, 7 transmembrane domains, and a C-terminal PDZ domain-binding motif. The FZD1 transcript is expressed in various tissues. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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