Basic Information

Symbol
FZD2
RNA class
mRNA
Alias
Frizzled Class Receptor 2 Frizzled 2, Seven Transmembrane Spanning Receptor Frizzled Family Receptor 2 Frizzled-2 Fz-2 FzE2 HFz2 Frizzled (Drosophila) Homolog 2 Frizzled Homolog 2 (Drosophila) Frizzled Homolog 2 OMOD2 Fz2
Location (GRCh38)
17:44557484-44561262
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001466.4
Sequence length
3779.0 nt
GC content
0.5578

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1488.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1555.84 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 910.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((..((((((.....(((((((.(((((.((.(((((.(((((((((.((((((((..((((...((.((.......))..))..))))..).)))))))((...)).((((..((((((.(((.........))).))))))..)))).))))))))).))))))))))))...(.(((.(((((.((((((((((.((((.(((((...(((((((........))..))))).))))))))))))))))))).))))).)))).)))).)))....(((((((.((((...(((.....)))....(((....))).)))).)))))..)).))))))..)))))...((((...(((((.((((((.......((((((((..(....)..)))))))).(((((((((((.....(((((((.......))))))).(((((((((..........)))))))))...(((((..((((.((((((((....))))...))))))))))))).......((((((.(((......(((..((((((((((..(((((((((((((...............))))))..)))))))..))))..)))).))..)))......))).))))))((((((((....))).)))))((((.(((...(((((((((.((((....((((.((((((...(((((((((((((.((((..(((((((((...)))).)))))))))))).))))))))))(((((((((.((((.(((((((..((.(((.(((((((...(((((((((.........))))...........((((...)))).(((((..((((.((..((((((((....(((.....((((((((((((((.((((...(((((((....)))))))(((((...)))))....)))).)).......))))).)))))))..)))...............((((((((......)))).)))))))))))).)))))).)))))((((((((..((......))..)))))))).((((((.(((.((((((((.((((((((.(((((........))))).))))))))((.....)).((((...))))..))))))))))).))))))..)))))....))))).))))).)).((((........))))(((...(((((((((.((((..((((((((.(((((((.........)))))))(((((..((((.((((((((...((((((((....))))...(((.....))).........))))..((((.....)))))))))))).)))).)))))........((((((.((((((.(((.(((((..((.((..(((((((((..((..((.(((((((..((((........)))).))))))))).))..)))))))))..)).))..))))).)))))).((((((((((((.(((((((((.(((((((.((((.((....))........))))...).)))))).))).)))....)))))))(((((..(((((.((..(((((((((..(((.(((((...((((((..((((((.........(((((((.(......))))))))....(((((((.((...)).))))))))))).))..))))))..))))).)))......(((((.(((((.......))))).)))))..((((((((....(((((((((((.........)))))..((((..((((.....))))..))))...)))))).))))))))))))))))).....((((((....))))))....))..)))))..)))))((((((((....))))))))))))))))...)))))))))..(((.((((.(.....).)))).)))))))))))............(((.((((((((....)))))))).))).....((((............))))..........((((....))))(((((.((((((......((.((((((((((..((((((.....))))))..)))))))))).)).((((((.(((......))).))))))..........))))))))))))))).).)))))))).)))))).)))))))).)))))))))(((.(((((((((((.((........)).)))))......))).))).)))............))))))..)))).(((((((((((........))))..))))))))))).))))))))).))).))))...(((((((((...((((((........................)).))))...))).))))))))))))))))).((((((((.((.....)).))).)).)))(((..(.....)..))).(((((....(((((((..(((((.....((((((((..(((((.....((((((((((((((((((.(((((((((.((.(.........(((((...(((((.((((.(((((((((((.((((((.(((.(.(((((((...(((.....))).)))))))))))(((((.(((.((....))))).)))))(((((((..((((((((((...((((.((((((((..(((.(((.....((((((((.((..((((((.(((.............))).))))))..)).(((((.......)))))...((((........)))))))))))).))).)))))))))))..))))))).)))))))...))))......))))))))).)))))...)))))))))).)))))..)))))(((((......(((((((......))))).))......))))).....).)).))))))))).))).)))))))).....)))))))..)))))..))))))))))))).)))))))))))).)))))).)))))))))((((((((((.(((((((((((((((.((((...........................(((((...........((((((((((.((((.(((.(((((((...((((((((..(((((((((((((((((((..((......(((((((((((((((((....)))..)))))))))........)))))......))..)))....))))))))..(((.((.(((((((((((((.....)))).))))))))))).))).((....))(((((((((((((.((.......))))))))))..)))))..((((.(.....)))))((((((..(....)..))))))......(((....)))..(((((((.(.(((((((.(((((((.((........((......)).....((((((((.(((....(((..........)))....))).)))).))))..))))))))).))))))))))))))))))))))).....)))))))).)))))))))).))))..(((((....)))))((((.((...))))))...(((((.((....)).))))).....................(((((((((((((((..............))))))))....))).))))....))).))))))).........)))))))))))))...)))))))).)).).))))))))))........................................
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((..((((((.....{{{((((.(((((.((.(((((.(((((((((.((((((((..(((({{{(,.((.......)}}}))..})))..).))))))),|...||.((((..((((((.(((.........))).))))))..)))).))))))))).))))))))))))...{.(((.(((((.((((((((({,((((.(((((...(((((({........)).,))))).))))))))))))))))))).))))).)))}.)))).})}....(((((((.((((...(((.....)))....(((....))).)))).)))))..}),))))))..)))))...((((...{((((.((((((..,,,..((((((((..(....)..)))))))).(((((((((((.,{,.(((((((.......)))))))..(((((((({((({{.,|.,},||||||..,((,(({{{{{{,(((((({{..,,)))),..))))}))))}}||{,....,({(((({(((((.....,,}}|||{|}|||{..((((((((((({(,..........,,,,))}))}}.))))))),,))))..}))}.))}})))}}....)))}),{{|{((,(({{,..}},))})))||(({{{({({{{(((((,{(({{{,{,,,,{||,.{{{{{{,,,(((((((((((((.({{(,.(((((((((...))))))))))}))))))}))))))))))(((((((((,((((,(((({{({((({(((,({,,{{{...{((((({({|{......{|}||,..,.......{{{{...}}},,(((((..((((.((..((((((({....(((.....((((((((((((((,((((...(((((((....)))))))(((((...)))))....)))).}}..,,,..))))).))))))).,)))...............((((((((......)))).)))),))))))).)))))).)))))|(((((((..((......))..)))))))}.((((((.(((.((((((((,{(((((((.(((((........))))).))))))))|{.....))||{{{...}}}}.,))))))))))).)))))).,|||||.,,.|||||{|||}}.,,.{{||,,,,,,.,),))|||}..{((((((((((((({{(..,,,,,.(((((((.,,...},.))))))){(({{{.((((.(((((((({,{(({{((((.,{{||||.,,|,|}}}..|},...,,....},,,.,((((.....)))))))))))).)))).))))}........||||||}}}|(((.(((.(((((.,((.((..(((((((((..((..((.(((((((..((((........)))).))))))))).))..)))))))))..)).)).,))))).)))))).},..,,,,.((((((((((((,.(((,.((((((((((...(((((({...{({,{(.(..((((..............))))..),,}}))))))))))...(((((((((..{{(,(((((...((((((..(((((,.........(((((((.{......))))))))....{((((((.||...)).))))))))}}}.}}..})))}}..}))))})))||||||(((((.(((((.......))))).)))))..(((((((,....((((({(((((,,.......}}})},.((((..((((|...,))))..))))...,)))}},))))))))))))))))).....)))))))}.,|...,}}}..))..)))....)))))((((((((....)))))))),{(((.{,{{{||.{{{,{{,{{({((.{{||.....,..))))})}))})}))})}}}........(((.((((((((....)))))))).)))...{,{{.,..}}}.,,{{{{||,,....}}}}}}||((,...})))((((,,((((((......{{.((((((((((..{{{{{{.....}))}},..)))))))))).,,.((((((.{({......,}),,}}))),.........)))))))))))))))))})))))))}.))))))})))))))).))))))))){{|,(((((((((((.((........)).))))),,....,}}.)))}}}}..}))})}....))))},..)))).(((((((((((........)))}.,))))))){{|,{||,......((((((((..,,.(((((..(..{(...})..)..))))),,.)))))))).......)))}}},,,.,.,}).))))))))))).{(((((((.((.....)).))).)).)))(((..{|...})..))).,{(((,...(((((((..(((((.....((((((((..(((((.....((((((((((((((((({.(((((((((.((.{.,,,.....{((((,.,(((((.((((,{((((((((((.((((((.(((.(.(((((((...(((.....})).)))))))}}}}(((((.(({{((....))))).))))){|,{{{{..{{(((((,.,..,((((.((((((((,.{({.(((.....((((((({.,{..((((((.{((.............))).))))))..},.(((((.......)))))..,((((........)))))))))))).))).,})))))))))..)))).,..}})})))...))))...,,.}),)))))).))))}..,))))}})))).))))),},)))}(((((,..{{.{{(((((......))))).}),}}...))))).}}}.}.)).))))))))).}))}}})))))),....}))))))..)))))..))))))))))))).))))))))))),.)))))).))))))))){(((((((((.(((((((((((((((,((({..........,{,..,,,,.......,{{{{{...........((((((({((,((((.((,{(((((((...((((((((,.(((((((((((((((((((..((......(((((((((((((((((....))}..)))))))))........)))))......))..)))....))))))))....,.((.(((((((((((((.....)))).))))))))))),}||,{{...|))(((((((((((((.((.......))))))))))..)))))..((((.{.....}))))((((((..(....)..))))))......(((....)))..(((((({,(.(((((({.((((((({((........((......)).....((((((((.(((...,({{..........)}}....))).)))).))))..))))))))).))))))))))))))))))))))).,...)))))))).)))))))))).)))}..{{{{{....|||||(((({.....,{||,,...(((((.((....)).)))))........,}}}}}},}},..{{{((({((((((((..............))))))))....)))}}})}...,))).))))))).........))))}))))))))...)))))))).)).).)))))))))}.......,,{..{{{{{{{{.....}}},})))}...}},

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001466.4 NCBI
AGUCCGACCGCGGCAAGCAAGCGGGCAGGCGCACCGCCCCCUCCCCCGC… 3779 nt 0.5578
Summary

This intronless gene is a member of the frizzled gene family. Members of this family encode seven-transmembrane domain proteins that are receptors for the wingless type MMTV integration site family of signaling proteins. This gene encodes a protein that is coupled to the beta-catenin canonical signaling pathway. Competition between the wingless-type MMTV integration site family, member 3A and wingless-type MMTV integration site family, member 5A gene products for binding of this protein is thought to regulate the beta-catenin-dependent and -independent pathways. [provided by RefSeq, Dec 2010]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.