Basic Information

Symbol
FZD3
RNA class
mRNA
Alias
Frizzled Class Receptor 3 Fz-3 Frizzled-3 Frizzled 3, Seven Transmembrane Spanning Receptor Frizzled Family Receptor 3 Frizzled (Drosophila) Homolog 3 Frizzled Homolog 3 (Drosophila) Frizzled Homolog 3 HFz3
Location (GRCh38)
8:28494205-28574267
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_017412.4
Sequence length
13770.0 nt
GC content
0.3494

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3624.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3900.64 kcal/mol
Frequency: 3.06029e-195
Diversity: 3245.24
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001412905.1 NCBI
GCGAAAGCUCGCUGUCGCUGGGAGGCGCGCGCCGGCGUUCCUCGGCCGC… 13839 nt 0.3496
NM_001412906.1 NCBI
GCGAAAGCUCGCUGUCGCUGGGAGGCGCGCGCCGGCGUUCCUCGGCCGC… 13191 nt 0.3471
NM_001412907.1 NCBI
GCGAAAGCUCGCUGUCGCUGGGAGGCGCGCGCCGGCGUUCCUCGGCCGC… 13575 nt 0.3485
NM_001412909.1 NCBI
GCGAAAGCUCGCUGUCGCUGGGAGGCGCGCGCCGGCGUUCCUCGGCCGC… 13660 nt 0.3485
NM_001412910.1 NCBI
GCGAAAGCUCGCUGUCGCUGGGAGGCGCGCGCCGGCGUUCCUCGGCCGC… 13706 nt 0.3488
NM_001412911.1 NCBI
GCGAAAGCUCGCUGUCGCUGGGAGGCGCGCGCCGGCGUUCCUCGGCCGC… 13765 nt 0.3494
NM_001412912.1 NCBI
GCGAAAGCUCGCUGUCGCUGGGAGGCGCGCGCCGGCGUUCCUCGGCCGC… 13720 nt 0.3491
NM_001412913.1 NCBI
GCGAAAGCUCGCUGUCGCUGGGAGGCGCGCGCCGGCGUUCCUCGGCCGC… 13766 nt 0.3493
NM_001412917.1 NCBI
GCGAAAGCUCGCUGUCGCUGGGAGGCGCGCGCCGGCGUUCCUCGGCCGC… 13793 nt 0.3493
NM_001412919.1 NCBI
GCGAAAGCUCGCUGUCGCUGGGAGGCGCGCGCCGGCGUUCCUCGGCCGC… 12994 nt 0.3450
Showing 1 to 10 of 17 entries
Summary

This gene is a member of the frizzled gene family. Members of this family encode seven-transmembrane domain proteins that are receptors for the wingless type MMTV integration site family of signaling proteins. Most frizzled receptors are coupled to the beta-catenin canonical signaling pathway. The function of this protein is unknown, although it may play a role in mammalian hair follicle development. Alternative splicing results in multiple transcript variants. This gene is a susceptibility locus for schizophrenia. [provided by RefSeq, Dec 2010]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that selective breeding for ethanol preference significantly altered gene expression and network connectivity in the nucleus accumbens shell, identifying the FZD3 as part of a group of differentially variable genes with higher variability skewed to the high preference line [Colville et al. DOI:10.1111/Gbb.12367].