Basic Information

Symbol
FZD3
RNA class
mRNA
Alias
Frizzled Class Receptor 3 Fz-3 Frizzled-3 Frizzled 3, Seven Transmembrane Spanning Receptor Frizzled Family Receptor 3 Frizzled (Drosophila) Homolog 3 Frizzled Homolog 3 (Drosophila) Frizzled Homolog 3 HFz3
Location (GRCh38)
8:28494205-28574267
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_017412.4
Sequence length
13770.0 nt
GC content
0.3494

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3624.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3900.64 kcal/mol
Frequency: 3.06029e-195
Diversity: 3245.24
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001412921.1 NCBI
GCGAAAGCUCGCUGUCGCUGGGAGGCGCGCGCCGGCGUUCCUCGGCCGC… 12939 nt 0.3449
NM_001412922.1 NCBI
GCGAAAGCUCGCUGUCGCUGGGAGGCGCGCGCCGGCGUUCCUCGGCCGC… 13527 nt 0.3471
NM_001412924.1 NCBI
GCGAAAGCUCGCUGUCGCUGGGAGGCGCGCGCCGGCGUUCCUCGGCCGC… 13892 nt 0.3513
NM_001412925.1 NCBI
GCGAAAGCUCGCUGUCGCUGGGAGGCGCGCGCCGGCGUUCCUCGGCCGC… 13938 nt 0.3516
NM_001412927.1 NCBI
GCGAAAGCUCGCUGUCGCUGGGAGGCGCGCGCCGGCGUUCCUCGGCCGC… 13617 nt 0.3488
NM_017412.4 NCBI
GCGAAAGCUCGCUGUCGCUGGGAGGCGCGCGCCGGCGUUCCUCGGCCGC… 13770 nt 0.3494
NM_145866.2 NCBI
GCGAAAGCUCGCUGUCGCUGGGAGGCGCGCGCCGGCGUUCCUCGGCCGC… 13724 nt 0.3491
Showing 11 to 17 of 17 entries
Summary

This gene is a member of the frizzled gene family. Members of this family encode seven-transmembrane domain proteins that are receptors for the wingless type MMTV integration site family of signaling proteins. Most frizzled receptors are coupled to the beta-catenin canonical signaling pathway. The function of this protein is unknown, although it may play a role in mammalian hair follicle development. Alternative splicing results in multiple transcript variants. This gene is a susceptibility locus for schizophrenia. [provided by RefSeq, Dec 2010]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that selective breeding for ethanol preference significantly altered gene expression and network connectivity in the nucleus accumbens shell, identifying the FZD3 as part of a group of differentially variable genes with higher variability skewed to the high preference line [Colville et al. DOI:10.1111/Gbb.12367].