Basic Information

Symbol
GAB1
RNA class
mRNA
Alias
GRB2 Associated Binding Protein 1 Growth Factor Receptor Bound Protein 2-Associated Protein 1 GRB2-Associated-Binding Protein 1 Deafness, Autosomal Recessive 26 GRB2-Associated Binder 1 DFNB26
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_002039.4
Sequence length
7774.0 nt
GC content
0.3801

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1972.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2129.04 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1602.11
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((..(((.......((((((((((.(((((((((..(((((...)))))((.(((..(((((((((.......((.(((((.((....)))))))))((((((((..((.....))..)))))))).((((.((.((((((.(..(((.(((....((((((((.((((..(((......)))....)))).)))))))).))).)))..).))..)))).)).))))((.((((((((((....))).))))))).)))))))))))))))))))))))))))))(((((((...((((.(((.((((((.....))))))..))))))))))))))....(((((...........)))))..........))))))..((((((...(((((((.(.(((((.....(.(((((((.....(((((......(((((((((((((..........(((..(((((((((...............(((((.((....)).)))))((((((((..((((............((((((.(((((.......)))).).))))))...((((.....))))))))....)))))))).((((.((....((((((((((.......((((((..(((((((((((....(((((((((...)))).)))))...............(((....))).(((.......)))...((((((.......)))))))))))))))))......))))))...((((((.......))))))..))).)))))))....)).)))).......(((((.......)))))..))))))))))))((((((...(((.(((((...((((...((((..(((......((((((((........(((....(((..(((.(((...................))).)))..))).((((.((......)).))))........(((((.......)))))....))).......))))))))......)))..))))...))))...........((((((((((((((((((((((((((((.((...........))...)))))))......(((((...((((...))))....)))))...))))))))))))))(((((.....)))))......(((....))).....((((......))))......)))))))......))))).)))...)))))).....(((((((...))))))))))))).)))))))))))).(((((..((((((.((...((.......))..)).))))))...)))))......))))))).)...............))))).).)))))))(((((.((.....)).).))))((.((((((((..((.(((((...((((((((((((((...((((((((((((.(((..((((((.........((((...)))).........))))))..)))..((.((((.....))))))..)))))))))..(((((((.(((((((....((((((((((((((((.((((((.....((((.....(((((.......)))))))))))))))..)))))))))...)))))))........(((.....(((((....))))).....)))......((((((((.(((....(((((((.((((((.((..((((.((((((((((((..((((((..(((....((((......))))..)))))))))(((...((((....))))...)))..((((...((((..(((((((..(((((.((((((((.............((((.....)))))))))))).....((..(((......)))..))((((...((((((..((((((.(((((.((((((((.............)))((((((.(((((.......(((((((((....)))))))))(((((..((.((((..................((((...)))).....((((..(((((..(((.(((((((((.((((((((.((((((.(......((((((.....((((((...........(((((((((...(.((.(.((((((((((((.(((.((........)).)))..........(((((...(((((((((......))).))))))...))))).....(((((..(((...((((....)))).((((((((.((..(((..(((((((.((((((((((((.(((((((...(((((((((..((((....))))..((((((.((((((((((((((((((((((((((...(((((...(..(((((...((((((..((((((((((((........(((((.......)))))..((((((((..(((((............((((...(((...(((((.((((((........(((....))))))))).)))))...)))....))))..(((((...(((((((((....)))))..))))))))).)))))..))))))))..((((.......))))(((((((((....)))))...))))((((((((((((((((..(((...((((((((((((((....((((....))))..............((((.....((((....))))))))..............(((((((((((((((........(((((.((.((((((((......((((((....(((((((...(((((((.(..(((....)))..))))))))............(((((.(((.........))).)))))(((((((....)))))))........))))))).)))))).((((.(((((...........))))).))))(((((((((((.((((((((.......((((((((((((((((((..(((((((((((...(((((((((.....((((..(((.....)))))))....)))))........((((((((((...)))))))))).))))....)))))))))))............(((((((((((.....((((((((((..(((((((((((.(((.(((....((((((((((.......))))))...)))))))))).)))))......((((((((((((((((((((.............((((.(((((((((((.....))))).))))))))))..((((((((.((((.((((.....)))))))).))))))))((((((.((...))))))))((((((((.......))))))))......((((((((((.......)))))).))))........((((....)))).....(((((((((((............................((..(((....)))..))..(((((..((........))..)))))......((((..(((((.(((((((((.(.......).))))))))).)))))..))))....((((.(((((((((........)))))))))...)))).((((((..((((((((((((((.(((...))).))))))....((((((((((.((((.....))))..(((....)))......(((((.(((((((((((((..(((((((.((((((.(((((.((............)).)))))...)))))))))))))...))))))).)))))).)).)))..............(((((((((((.....).)))))))))).(((((((..((((......)))).))))))).))).))))))).)))))))).))))))...))))))).))))..((((((((((..(((..........)))..)))).)))))))))))).))))......))).)))))))..(((((....)))))...)))))))))..)))))))...))))))))))).....................((((...)))).(((((....((((((((.(((((((((((((((.....(((((((((((((((.........)))))...)))))))))).((((((((.(((((..........(((((.....((((((.....))))))((((((...))))))..........)))))........))))).)))))))).((((.........))))(((((.....((((((((.....(((((.(.....).))))).....((((((..(((........)))..))))))..(((.....))).........)))))))))))))(((....)))....)))))).))...))))))).)))))))).....)))))..(((((((...((((((((.((((((((((...........))))))))))(((((.((((...)))).)))))....))))))))....))))))).((((.((.(((((....))))).)).)))).)))))).))))))))))))...........(((((((((...((((((((((........((((...(((((.((((.(((((......((((((((((((((((((((......((((((......))).)))......))))))..))))(((((((((.((.(((((((...(((((((.....................)))))))....))))))))).)))))))))))))))))))(((..(((((((.(((((.........))..)))..((((((((((((.....(((((((...)))))))....))))))).))))).........))))))))))...))))).)))).)))))...(((((.(((((((............................)))))))))))).(((((((............((((((((((.((.((((...(((((.((.......((((((((((((((((((........))))).))))))))............)))))..)).)))))......((((.((.....((((((..(((((((.......))))))).....))))))...)).))))...)))).)).)))))))))).........))))))).(((((((..................)))))))..........((((((.(((((((..((..((((.....)))))).)))))))))))))....((((....))))...)))).........))))))))))..))).))))))......((((((...))))))))))..)))).)))))))...))))...........)))))))).)).)))))........))))))))).))))))))))))))))))))(((((((((....)))))))))...((((((((.....((((((..............(((((((...((((((.........))))))....))))))).....((((.(((........))).))))....)))))).......)))))))).......))).....)))))..)))))))))))(((((((.....(((((((.....)))))))....)))))))..)))))))))))).....(((((....))))).............)))))).)))))..)...)))))..........(((((((....))))))).....(((........)))....(((((((((.......)).))))))).......(((...))).(((..........))))))))))).))..)))))..))))))..)))))..)))))).))))))))).....(((....))).........)))).((((((((((((((.................(((((((...((..((((.(((.....(((((......((((((.(...(((.....)))...).)))))))))))...(((((....)))))........(((((((((((((((((.((((.(((((((((.(((((((..((((((((((......((((((..........((((((....)))))).......)))))).....)))))))).))..)))))))..........)))))))))...)))).).))...))))))...)))))))).....(((((....)))))..((((....)))).(((((((((.(((.((((((...((((.((.(((.....))).)).))))..)))))).))))))))))))................((((((....)))))).....((((((((((((...(((......((((((.(((((..(((((((((.....(((((.....))))).(((((((...............))))))).....))))))................))).))))).))))))......)))...))))))))))))........))).))))..))...))))))).................((((.....)).))...)))))))).........))))))..........(((((..(((........))).))))).)))))))..)))))))).))))................))).))).....)).))))))))...))))))))..)))))..))))))).).)))...))))))))).........(((((...((((..........)))).)))))..........)))))).....))))))((((((.....))))))).)))))))))))))).)))))......(((((((((((((((....)))))))........))).))))).............((((....(((((.....)))))..)))).......(((((((((.((((((((.(.....(((.((......)).)))......).))))..)))).))))).))))(((((....)))))............)))))))..))))))))).....)))).))..)))))..........(((((((((....))))))))).......(((((((.((((..((((...))))....)))).))))))).......))))))))))).....)))))))))).))).)))....))))))..)))))))))....)))))))..))))....))))........(((........))).(((((((....)))))))..((((.(((((.......))))))))).....(((....)))....((((((...(((((((((.((......)).)).))))))).))))))...............))))))))).......))).))))..)).)))..)))..))).))))...))).))).))))))))))))))))))))))...)))))..))))))))).....................((((((.....(((((((..(((((....)))))..)))..))))..)))))).)))))...)).))))))...)).))))))))((((((.(........).)))))).(((((..((((..(((((((((((((.....))))))))))..)))..))))..)))))))).))))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((..(((..,.{{,(((((,((((.(((((((({..(((((...)))))((.(((..(((((((((.......((.(((({,((....)))))))))((((((((..((.....))..)))))))).((((.((.((((((.(..(((.(((....((((((((.((((,.(((......)))....)))).)))))))).))).)))..)..)).)))).)).))))((.((((((((((....))).))))))).))))))))))))))))}))))))))))))(((((((...((((.(((.((((((.....))))))..))))))))))))))....(((((...........)))))..........,||||,,{((((({...(((((((((,(((((...,{,.(((((((.....{(((({.....{((((((((((((..........{((..(((((((((.,.......,,....{((((.{,....}}.))))}((((((((..((((.,,,,....,,.((((((.(((((,{....})))).).)))))).,,|{{{.....}})}))))....)))))))).((((.((....((((((((((.......((((({..(((((((((((,...(((((((({...}))),})))).{..,...,{((,{,({(....))).|,|,}}}...,,,...{(((((.......)))))))))))))))))....,.)),,}}...((((((.......))))))..))).)))))))....)).))))......,(((((.......))))).,)))))))))))}((((((...(((.(((((..,(((({{.,,,,..{{{....|,{(((((((.........,,....(((..(((.(((.,.................))).)))..))).,{({....,....,,.}|||.....,,,(((((.......)))))....,)),.,,...)))))))).,}))}))}..}||,...,|,,...........((((((((((((((((((((((((((((.((...........))...)))))))......(((((...((((...))))....)))))...)))))))))))))){((((.....))))}......(((....))).,,,.((((......))))...,}.)))))))......))))).)))...)))))).....(((((({...})))))))))))).)))))))}||}}.{||{{..{(((((.((...{{.......}}..)).))))))...})))).,....))))))),)...............)))))}).)))))))({(({.((.....)).}}}}))((.{{((((((..{{.(((({,,.((((((((((((((...(((((((((((,.(((..((((((.........((({...)))).........))))))..)))..((.((((.....))))))..}))))))))..((((({{((((((((....((((((((((((((((.((((({....,((((.....(((((.......))))))))))))))).})))))))))...)))))))........(((.....(((((....))))).....}))......{(((((((.(((,,..(((((((.((((((.((..((((.((((((((((((..((((((..(((....((((......))))..))))))))),{{...{{{{....||||,..}}}..{|||,,,{{{{..(((((((..(((((.(((((((({,{,....||{..,|||.....}))))))))))).....((..(((......)))..))((((...((((((.,{,,{{(.((({,{((((((({,............,,.((((((.(((((.......{((((((((....})))))))|(((((..((.((((,,.....||.........((((...)))).....((((..(((((..(((.(((((((((.((((((((.((((((.{.....,((((((.....((((((...........,((((((((...(.((.{.((((((({((((.(((.((........)).))).........,(((((.,.(((((((((......})),})))))...))))).....(((((..(((...((((....)))).((((((((.((.,(((,.{((({((,((({({{({(({{({,,,,|}}}(((((((((..((((....))))..((((((.((((((((((((((((((((((((((.{.{((((...{..(((((...((((((..((((((((((((........(((((.......)))))..((((((((..(((((....,,....,,{{,,.,.{{{.,.(((((.((((((........|{{....))})))))).)))))|||||,,,,.}}}|,.{,{{,..,{{{,{{|||....})))},,)}))))),),)))))..))))))))..((((.......))))(((({{{((....,}})),..)))){(((((((((((((((..(((...((((((((((((((....{(({....}))}...........,,,|,,,.....((((....))))|||,..............(((((((((((((((......,{(((((.{(,((((((((....,.((((((,...,{{{,,..,|{{{|||||||,,||,{{{{,,..}}}|,,,|,,.,.,...,{{{{{(((((((............,,.))))))}.({(({...(((....)))...))))){{{{|,|{{((,...{{.(((((.((((((...((((.((((((((.(((......((((..(((((((((((((((((((((((.{(((((((((((...((((({{{,.,{{,,,....{({{{{,,{{(((,(,,,,,,((((..(.(((((((((((((...)))))))))).))))..)))},.)))),.}}},,)}}}},,,{((((((((((.....((((((((((,.{((((({((((.(((.{{{{({((((.((,,,,.,,.}}})))),,...}},.}})))).)))))......(((((((((((((((((((({,{{{,,({,,{,((((.(((((((((((.....)))))}}}))))))))..,{||||||,{,,,,(((({,,,||||}.,|}||}}}}}},((((({,({...}))))))),(((((((.......)))))))},{{,..(((({((((({......,,)))),))))}}}},...((((....)))).{{{{({{{,,,,{||,||,........................{{..,{{....})}..}}..{((((..{{,.......}}..))))}......,{{{..(((((.(((((((((.{.,....,}.))))))))).)))))..}}}}....||||,(((((((((........)))))))))...}}}}.((((((..((((((({((((((.{((...))}.))))))....((((((((((.((((.....))))..(((....)))......(((((.(((((((((((((..((((((,{((((((.(((((.{{{...........,,.)))))...)))))))))))))...))))))),,))))).))},))..............(((((((((((.....),}))))))))).(((((((..((((......)))).))))))).))),,)))))).)))))))).))))))...}}}}}}}.}}}},.((((((((((..(((..........)))..)))).))))))}))))).))))......)))}}})))))..(((((....)))))...)))))))))..)))))))...))))))))))}............,||,.....|||,.,,}}}},(((((...,((((((((.(((((((({((((((.....(((((((((((((((.........)))))...)))))))))).|(((((((.(((((..........{((((.,{,.((((((.....)))))|((((((...}))))),......,..)))))........))))).)))))))}.{{{{.........}}}}((((,....{((((((((.....{((((.{.....},)}}}|,,{{.{((({{..(((,,......,,}..))))),..|||....}))}.........)))))))))))))(((....})),...)))))).}}...})))))).)))))))).,...))}}}..(((((((...((((((((.((((((((((.,.......,.))))))))))(((((.((({...}))).)))))....))))))))....))))))),{|}}}}))},,.)))))))))),.....)).)))))).))))))))))),(((((((((((((((...(((..((((.{{..{{{{..,,,{{.{,{(((({...,}}})).}}....{{(((((((,,,,,,,||||||}}},..(((,,...,..,{|{{|||,,....||||||..}||,(((((((((.((.(((((((...(((((((..,{{........,.}}.,..)))))))....))))))))).))))))))),)))))))),||||}||}}|.|,{{{{{.........))}.,}}..((((((((((((.....(((((((...)))))))....))))))).))))).........}))))..}}.))))..))))))))))).))))))).{,((((((....)))))),.})))))}}))....))}.)))))))))))).)))))).))))}.,,.,,.)))}||,}|}||((({(((.(((((.((....,.,{{{{{(((((((((((((........))))).))))))))............}}}},..)}.)))))...,{|{|,,(((((((({{({.,(({((((((((...(((........))))))))))}.,..,}...))))....))))))))..{((({.......)))))..,,,||||,}}}}}}}.......},,}}},})),...,|}},,}|||||,{{{(((({{(({,,,((((({{,,,,,.,))}}}}},........,}}|},,,})}},,.}}}}}},,......|}}|}|||,,,,}},.|}||||{{{{.,({{{{|...}})))),,.},,}})),},})))))))},},...........)))))))).}}.))))).}}.....))))))))).))))))))))))))))))))(((((((({....}))))))))...((((((((.....(((((({{{({{{{{.{{{{(((((,,...((,,,,...,.....}}}}||,.,.,,,}},,..,}}||,|}|||}}},.}}}))}.,,})}}}.)))))).......)))))))).......,}).....)))))..))))))))))}(((((((.....(((((((.....)))))))....))))))),.)))))))))))).....(((({....})))).............)))))).)))))..}...)))))}......,,.(((((((....)))))}),..|.(((........)))..{,{(((((((..{.....}}}))))))),..,.,.(((...))),(((..........))))))))))).))..)))))..))))))}.}))))..)))))).)))))))))..,,,||{,||.,},..||.....||},.((((((((((((((..,.{(({{{,,.....(((....,,)||,{,((({{{,,....{((((...,.,((((((.{...(((.....}}}...}.))))))}})}}.{{((((({{{{{............(((((((((((((((((.((((.(((((((((,(((((((..{{((((((((...,,.((((((....,,....((((((....))))))...,...)))))).....)))))))).)}..)))))))..........)))))))))...)))).).)),..})))))...)))))))).....(((((....)))))..((((....)))).(((((((((.{((.((((({...((((.({,(((......))})).))))..}))))).))}))))))))).,{,{,.,,}......{{((((....)))))).))))))||||||,,,|}}}||{....,,||||||.{{(({.,{{,((((((.....(((((.....))))).(((((((...............))))))).....))))))....,,,..,{,,|{,||,.|||||,}|||}}.|,..,|||,|{|||,,,,))))}.,,,.........,}}}}))}}}}}))}||,,,.............,||,,.....})})}...)))))))).........))))))......,,|,|{{|,..||{........|||,||||}.,,,,}}}..))))))}}.}|||,......,,,,.....}}}.))).....)).))))))))...))))))))..)))))..))))))).,.)),..,))))))))|,,......,{{({,...((((..........)))).}},}}},,...,...)))))).....})))))|(((((.....)))))},.)))))})))))))).))))),.{{{{(,((((({(((((((....))))))),}}}....},,.))))).............((({..,.(((((.....)))))..)))).......(((((((((.((((((((.({{...(((.((......)).)))...}}},,))),.,)))).))))).)))){((({....})))}......,,.,..)))))))..))))))))).....}))).))..))))),.....,...(((((((((....))))))))).......(((((((.((((.{((((...)))}.}..)))).))))))).......))))))))))),.}}.})))))}))).))}.}}..,,.))))))..)))))))))....)))))))..}}}}.,..}}}}..{{{{{,(((........))).(((((((....))))))}..,,,|.{,,||,,,,..,||}}}}})}},}..((({,,,,||..{{(((......|}}}|{||{|||||||,.,..,,.,)))))}.,}}}}},..............)))))))))}......))).))))..}}.))),,}))..))).))))..,))).))),})))))))))))))))))),})}},)))))..)))))))))...,,...{{,......,.,.,,,,,..,...(((((((..(((((....)))))..)))..))))..,,,}}},)))))...},.))))))...)).)))))))))}|}}}.}..,|||{|,,,,,}.},|((((..((((..(({((((((((((.....))))))))))..}))..))))..)))),))).))))))......

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AGAGUCCCGCUGAGUCCGAGCGCUGCUGAGGCAGCUGGCGAGACGGCAC… 7774 nt 0.3801
AGAGUCCCGCUGAGUCCGAGCGCUGCUGAGGCAGCUGGCGAGACGGCAC… 7864 nt 0.3802
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the IRS1-like multisubstrate docking protein family. It is an important mediator of branching tubulogenesis and plays a central role in cellular growth response, transformation and apoptosis. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.