Basic Information

Symbol
GAB2
RNA class
mRNA
Alias
GRB2 Associated Binding Protein 2 KIAA0571 Growth Factor Receptor Bound Protein 2-Associated Protein 2 GRB2-Associated-Binding Protein 2 Grb2-Associated Binder 2 Pp100 GRB2-Associated Binder 2
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_080491.3
Sequence length
6110.0 nt
GC content
0.5458

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2272.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2386.18 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1498.09
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((...((((((((((((((((..((((((((((((((((((.(.(((.(.((((((..(((.......)))..)))))).)..)))))))))).)).).)))))))))...))))))))))..((..(((((((((...((((((..((((((...((.((((.....)))).))......(((((((....((((.(((((((.(((.(((((((((((.((((((((((((...((((............(((.(((....)))..)))((((...(((...(((((((...(((((........))))).(((((.....)))))(((((((((.(((...(((((((.((..........)))))))))....)))))).))))))...))))))))))..))))....)))).))))))))))))((((......))))........(((((((((((.((....(((...)))...))))))))))))))))))......))))))...))).)))..)))).))))....)))))))..)))))).))).)))....))))))))))).......(((((((.((((.....(((((....)))))....((((((..((((((.(((((((((.(((..((((...((((.....(((((....)))))......))))............(((.....))).((((((....))))))....(((((((((((.((((((......))))))((((((((.(((.((.....(((((...))))))).)))))))))))..((((...((((......))))((((.....)))).))))..((((...))))((((.((((((((((.((((................(((......(((((......)))))......)))..((((...))))(((..((((((((.(((.(((((((.....((((((((((((((((((((.....((..(((.(((((((((((((((((((((..(((....(((((((((.(((((((((..(((((((((.((((((((((.(((.((((((.......)).....(((((....)))))....(((((((..(((......(((((...((((.((.((((((.(((......))).......((.....))(((.(((.((....))))).))).((((.((.......((.(((((((((((((......(((.(((((..(((.(((.((((((.(((....(((..(((((.((((.((...(((((((...(((....((((((((......)))).....)))).(.((((((((.((..(((((.....)))))(((((((((((((...((((..........(((((((....(((.((.(((.((((((...(((....)))...)).))))...))).)))))..((((..((((((((((((..(.((.((....)))).)..))).....)))..))).))))))))))))))....(((((.....(((((.....(((......((((((.(((............))).))))))))).....)))))......))))).............))))...))))))...)))))))....((((.(((.(((........((((...))))...(((((((..((((.(((((((((.....((((((...))))))(((((((....(((((.....((((((....(.(((((((....(((((((((.(.................(((.((((.............)))))))........((((((((((((((((((.....((((.(((..((..(((((((((...............)))))....)))).))..)))))))....(((.(((((((((..(((((((((((((.((((((((.((.((((.(......).)))))).)))))).))..))...)))))....(((((....(((...((((((........))))))..)))((((.(....((((.((((..((....))..))))))))..)))))((((.((((((((.......((.(.(((((.....))))).).)))))))).)).)))).....)))))....((((.((((((((..((((...(((((((.(((((.....((((((((((.(((((...((((..(((((..((((.(..((((((...))))))).)))))))))))))((((.(((((.(((((.((((((((((.((((((((....))))...........((((((.((((((...((((((((((..........))).))))..)))(((((((((((((.......(((((((((.((((.((.(((((((((((((((((((((((((((..((.........))..))))))....))))).)))))..))))))))))).))))))..........((((.......)))).................))))))))))))).)))....(((...)))....(((.(((((((.((((((((......)))))))).)))).))).)))......))))))..))))).)..)))))).)))).).)))))))))))))).))))....).))))((((((...((......))..))))))..((....)).)))))))))))))))((((((((.....))))))))))))).))))).))..)))).))))....)))).))))...((...((....))...))..((.....)).))))))))))))))).))).))))))).)..)))))))).))).)))))))..((((....))))((((...((((......))))....))))..((((...(((((((((((.....((.((..(((..((((....((.......))....))))..)))..)).)).....))).)))........))))).))))......))....))))))).)....)))))))))))..))))))).....))))))..))))))))))))))..)))))).)))))))))))))).)..))))))))))((.((((((....)))))).)))).)))))))))..)))))))))))).)))..)))..))....))))))......)))))).))))))).))...)).))))..(((((..........((((........))))...)))))((((((((((.....))))))....)))))))))).)).)))))))))......)))(((((((((((..((....)).))))(((.(((((.((((..((((((((((((...))))))((((.((((((.(((.................(((((......)))))..........(((((((..((((......((.(((((.((.(.(.((((....)))).).).))))))).))...))))..)))))))))))))))).))))))))))..)))))))))...)))((((....)))).(((((((....)))))))))))))))))))))..((((((((((((((((..(((((((..(((((........)))))..((((..........)))).(((((((((((((((..((((((..((((..((((((((((........)))))))...))).))))..))))))...))))....)).)))))))))((((.((..(((...))))).))))..........)))))))...)))))))))((((((......))))))..............)))))))((((((((.(((((....((((..........((((((..(((((((((...((((..((((.((((((.....)))))).((((......))))......(((((((((..((((..((((...)))))))))))))).)))(((((((..(((((..((((..(((..((...((........))....))..)))..)))))))))..))))))).............))))...))))..))))..)))))...))))))........))))....))))).)))).))))))))))))).))))))))..))))).....)))).)))))))))(((..(((((((.(((((((.(((((.((((....((((((....)))))).(((((.((.(((((((.....((((((((((((((.(((((.(((...(((((..((((((((.((((((((..((((..(((((.(((.......))).)))))......((((...(((((...((((....))))...))))))))).((((....))))..((((..((((....((((.((((((((..(((((((((((.(.(((....))).)..)))))))))))..(((..((((((.......((((((......)))))).)))))).))).(((......(((.((((...((((....)))).........(((((((.(((((.((((((((((((((..(((((((.((((.........))))))).))))..))))....((((((((.....(((.(((..(((.((.((((.....))))..)))))...)))))))))))))).......(((((....)))))))))))((((((((..(((((((.((.(((...........((....))))).)).)))))))......)))))))).(((((((.......)))))))....)))))).)))))))))))))).))).......)))......)))).)))).))))..))))..))))..(((((.......)))))...((.(((((.....))))))).((((((((((....))))))))))))))))))))))((((((((((((((..(((((.....((((.((.....))))))..)))))..)).)))....))))))))).(((...))).(((....)))))))))))..))))))))))))).(((((((((.((..(((((((((.((...((.(((((((((((((..(((.(((((((((((..((((.(.(((.(.(((((((.(((((.......(((((...)))))..))))))))))))).)))).))))..))))).)))))).)))..)))).))))...))))))).((((((((((((((((.....)))).)))))))))))).)).))))))))).........))..)))))))))...........((((..((((.(((((...((..........))...))))).))))...))))...)))).)))).)))))).((((.........))))..)))).))).))...))))).)))).))))))))))))..))))))).)))..)))).((.((((..((((((.........(((((((((((((.((....(((((((...))))))).)).)))))))))))))))))))..)))).))...)))))....)))..))..))))).)))))))))))..))).)))..))...(((((.(((...))).)))))....))))...))))))......)))))))))).....(((....))))))))...)).))).)))))))).)))........((((((......))))))))))))))))).))).))))....((((((((((((...)))))))).))))..)).))))))))).......((((((...))))))(((((((.(((((.......(((((........)))))......))))).)))))))).)))..)))))))))........)))))))))))))))))))...))).)))))))))))))))........(((.(((((.......((((......)))).........))))).)))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
....(((((...((((((((((((((((..(((((((((((((((((({(.(((.(.((((({..(((,,.....}))}})))))).,..)))))))))).)).).)))))))))...)))))))))}..((..(((((((((...((((((..((((((...((.((((,...,)))).))......(((((((....((((.(((((((.(((.(((((((((((.((((((((((((...(({{......,,{|..{{{.(({....)))..)))||{({..(((...(((((((...(((((........))))).(((((.....)))))(((((((((.,{(...(((((({.{{..........}}}))))))....,,,)))},)))))...))))))))))...}},....)))}.))))))))))))((((......))))........(((((((((((,((,,,.{{{.,,)}}...))))))))))))))))))......))))))...))).)))..)))).))))....)))))))..)))))).))).)))....))))))))))).......{((((((.((({.....(((((....}))))....((((((,.,(((((.((((((((({(((,,({{,{((((((,..,(((({..,,|}.{{{(({....|||............|||.....)))}||{{|{....))))))....(((((((({{{,((({{{......))))}}((((((((.(({.((.....(((((...))))))).})))))))))).,((((...((((......)))}((((.....)))).))))..((((...))))((((.((((((((({{((((.,......,...{{{.,,({.,({{(((({.{,{.{||,,,..}}}.))).,|||,...))))}{|..((((((((.(((.(((((((.....{(((((((((((((((((((.....{(.,(((.|({((((((((((((((((,,..,,,{(,.,,|||(({(.(((((((({..(((((((((.((((((((((.(((.(((((..{....{((((...(((((....)))))....,((((((((.(((((({.(((({.{(((((.((.(((((((({{...,{{|||.......|||.{{{,|(((.(({{((....)})}}.||}.|||,,||.......((.(((((((((((((.,....(((.(((((..(((.(((.((((((.(((....(((,,(((((.((({,((...{((((((.,,((,.,..{{,{(({{......)})).....)}}}.{,,,||||||}||..||{|{,,,,,||||}(((((({{{{{{{.|.|||||,...,{,{{(((({{,,,{.(((.{{.{{{.,{||||...{{{....})),},)),}))),..}|},}}}}}.{((({..((((({(({{{(,,(.((.((....)))).}.,))),....}}}..})).))))})))}}}}}}}}}}|{{{{||,,,(((({,,,,.{{,......((((((,(((......,,,,,,||},||}}}}||,....,}}}}}...,||}|},.||}},.,|||...||}}...)),}}|,..||||}}}..,.{(((.{{(,({(........|{||,.,))))...((((((({.{(((.(((((((((...,,((({{{...)))}},(((((((....((((,....{((((((....{.(((((((.,..((({(({({{(.......||.....{{.(((.((({..{,,,,,.,{,,}|}||}|..|,....((((((((((((((((((.....((((.(((.,({.,(({((((((...............))))).,,,)})}.}}.,)))))))....(((.(((((((({.,(((((((({(({,.((((((((.({(((((.(......).)))))).)))))).))..||,,,|||||....(((((.{..(((..,((((((........)))))).,)))((((.(....((((.((((..((....))..))))))))..)))))((((.(((((((,......,((.{.(((({.....})))).).)))))))))}}.)))).....)))))..,.{{((,(({{({,({{(,((,..,((((((,({(((((({.((((((((({{(((((..{((({..(((((..((((.,..((((((...))))))}.)))))))))))))|||{.{((((.(((((.((((((((((.((((((((....))))......,,...((((((.((((((...,,.(((((((..........))).))))...,|((((({(((((((.......(((((((((.((((.((.(((((((((((((((((((((((((((..({.........)}..))))))....))))).))))}..))))))))))).))))))..........((({.......)})),...,............)))))))))))))},}}....{{,...}))....(((.(((((((.((((((((......)))))))).)))).))).))).,..,,))))}}..))))).)..)))))).)))).).)))))))))))))).))))....}.}}}}((((((...,{......))..))))))..|{....)).))))))))))))))){(((((((.....)))))))))}}}}.}}})).)),.)),).})))....,))).)))).....,,,}|},..}}}.}}}}.||..}}.},.))))))))))))))).))).))))))).),.}))))))).))|{||||||,..((((....)))){{{{.,,|||{......))))...,)))),||,||}}}|{{{{|||.||,.,|.((,((..(((..((((...,((.......,,...,))))..)))..)).)}..,||})}.}}),..,,...))))).})),.....}))..,.))))))).}....)))))))))))..))))))).,,..))))))..))))))))))))))..||||}}.)))),.,,)))))}}).}}))))))))}{(.(((((|....)))))).)))),))))})))),.)))}},}))))).)))..)))..))}...})))))....,.)))))).))))))).))..{|,,||||...,|||}}.,.,,...{{{(........)))}...}))))}||.{{{{{(.....)))))).,...,)))))))).)).))))))))).....{{|.((((((({...(((({.({{{(((.{.((((,,......,)))).|.)))}|||{{(((((((((({,((((,,.((({{{...{((,({.,{.,(((({(,.{{{.{{|,.{{{{,.,,({({{((({{((((,{{{{{((,{{{{,.{|}|}|,|{((....)))}.}.}.|||||||{||.,.,|})|||)}}|}}}}}}}}},}}}),.)))))}}})))))})))}}|}||{(({....}))}.(((((((....))))))),}}}}}}|||,,||.,{{{,{{{({(((((({..(((((((.,(((((........))))).{(({{{{{,{{{{{{...}}}))).})))))|||({,(((({...(((({.((((((((((........)))))))...))).}}))}})))))),.,})))},,,}}.}}}}}}}}|((((.((,.,{,...}}))).})))}......,..}}))))).,.)))))))))((((((......))))))}}}}}}},},},..}}}}}},((((,,,,||||.,....,|||,...,{{..,(((((,..)))}}}.||,..)))))))))))|{{((((....,,))))......})))).)),)))))).|},||,,,.,,{{,..{{{{...)))),}},,...)))))))..)))))))}{(((({((({,,.,..|{,,|||,...,,,,||..,,|}.,|||.|||||||.}},..,.}}}},....}))).....))}.,,)).}.})},,..)))))...,.(((((((.{{..,........))))))))).)..)))))))))).))))))))..))))).....)))).))))))))){,,..(((((((.(((((((.(((((.(((((((((((((({.{,{(||{({(((((.(({({{{{{,.,,..((((((((((((((.(((({{(((...(((((..((((((((.((((((((..((((..(((((.((({....},})).}))))....,.((({..,(((((...((((....))))..,))))))))),{(((....)))}..((((..((((.(..((((.((((((((..(((((((((((.(.(((....))).)..))))))))))|,.(((..((((((.......((((((......)))))).)))))).))).|||.....,((({(({{...{{{{....}}}},,}......((((({{{(((((.((((((((((((((..(((((((.((((,......,}))))))).))))..))))....((((((((.....((({{((..(((.((.((((.....)))),.)))))..,)))))))))))))).......(((((....)))))))))))((((((((.,(((((((.((.((,...,||.....{{...,)))}}.)).)))))))......)))))))).(((((((.......)))))))....)))))).)))))))))),|||.,,,.......,)},.....)))).)))).)))).,))))..))))..{{{((,,.....}))))...,,.(((((.....)))))),.((((((((((....))))))))))))))))))))))((((((((((((((..(((((.....(({{{((.....))))))..)))))..)).)))}...)))))))))..(({,({,...|)).,))..))))))))..)))))))))))}),(((((((((.((..(((((((((.((...({.(((((((((((((..(((.(((((((((((..((((.,.(((.(.(((((({,(((((.......(((((...)))))..))))))))))))).)))).))))..)))))}}))))).)))..)))).))))...))))))).((((((((((((((((.....)))).)))))))))))).)}.))))))))).........))..)))))))))...........{{{{..{(((.(((((...{{..........))...))))).)))|...))))...)))).))))))})))),))||,}}|.....)))).,))))})),.,,)))),,,,.)))).))))))))))))..))))))).,}|,,||||,,{.((((..((((((.........((((((((((((({(,....(((((((...)))))))})).}))))))))))))))))))..))))})}|||))}}|,...,)}}}))..))))).)))))))))))..))}.)))..)),,,(((((.{{,...})).))))).,..))))..,))))))......)))))))))}.....(((....))))))))...)).))).)))))))).)),.,,,....{(((((......)))))))))))))))))},)).))))....,{{{((((((((...}))))))).}}},..}}.))))))))).......{{{{{{,..||||||,,{{{{{.{{{{{.......{{{{{.,...,..))))}...,,,))))).))))))}}}}}},,}}}))))))........))))))))))))))),)))...)))}}))))))))))))))........(((.(((((...,,..((((......)))).,}......))))).)))..

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AAACAUUGCACUUAGCCAUUCAGAUGAUAACUUGGAUCAGAAAUUUUGA… 6095 nt 0.5362
CCCUGGCCUCCCGCGAGCUGCGCACCGCCGGCCGCUGCCCCAGCUGCCC… 6110 nt 0.5458
Summary

This gene is a member of the GRB2-associated binding protein (GAB) gene family. These proteins contain pleckstrin homology (PH) domain, and bind SHP2 tyrosine phosphatase and GRB2 adapter protein. They act as adapters for transmitting various signals in response to stimuli through cytokine and growth factor receptors, and T- and B-cell antigen receptors. The protein encoded by this gene is the principal activator of phosphatidylinositol-3 kinase in response to activation of the high affinity IgE receptor. Two alternatively spliced transcripts encoding different isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2009]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.