Basic Information

Symbol
GABARAP
RNA class
mRNA
Alias
GABA Type A Receptor-Associated Protein MM46 GABA(A) Receptor-Associated Protein ATG8A Gamma-Aminobutyric Acid Receptor-Associated Protein Epididymis Secretory Sperm Binding Protein GABARAP-A FLC3B
Location (GRCh38)
17:7240008-7242449
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_007278.2
Sequence length
1319.0 nt
GC content
0.4882

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-419.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -447.21 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 419.31
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_007278.2 NCBI
GCAAAUUCGUGGAUCGCUCCGCUGAAUCCGCCCGCGCGUCGCCGCCGUC… 1319 nt 0.4882
Summary

Gamma-aminobutyric acid A receptors [GABA(A) receptors] are ligand-gated chloride channels that mediate inhibitory neurotransmission. This gene encodes GABA(A) receptor-associated protein, which is highly positively charged in its N-terminus and shares sequence similarity with light chain-3 of microtubule-associated proteins 1A and 1B. This protein clusters neurotransmitter receptors by mediating interaction with the cytoskeleton. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in the Australian sheep blowfly *Lucilia cuprina* identified the GABARAP as a homolog present within a large expressed sequence tag collection, where it was categorized as a target protein associated with insecticide resistance [Lee et al. DOI:10.1186/1471-2164-12-406].