Basic Information
Symbol
GABARAPL1
RNA class
mRNA
Alias
GABA Type A Receptor Associated Protein Like 1
APG8L
ATG8L
ATG8B
Gec1
Gamma-Aminobutyric Acid Receptor-Associated Protein-Like 1
GABA(A) Receptor-Associated Protein-Like 1
Glandular Epithelial Cell Protein 1
Early Estrogen-Regulated Protein
GABA(A) Receptor-Associated Protein Like 1
APG8-LIKE
GEC-1
ATG8
GEC1
Location (GRCh38)
12:10212458-10223128
Forensic tag(s)
Time since deposition estimation
MANE select
Transcript ID
NM_031412.4
Sequence length
1883.0 nt
GC content
0.4891
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-629.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-662.28 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
336.59
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| GUUUUUGUGCUCCCAGCUCUAGCGAAAAGCCGCCGGUAUUUCUCCAUCU… | 965 nt | 0.5036 | |
| GUUUUUGUGCUCCCAGCUCUAGCGAAAAGCCGCCGGUAUUUCUCCAUCU… | 1883 nt | 0.4891 |
Summary
Enables Tat protein binding activity; phospholipid binding activity; and ubiquitin protein ligase binding activity. Predicted to be involved in cellular response to nitrogen starvation and macroautophagy. Located in several cellular components, including autophagosome; ciliary basal body; and mitochondrion. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]
Forensic Context
A study in humans established a targeted RNA sequencing protocol for predicting the time-of-day of bloodstain deposition, where the GABARAPL1 was included as a candidate mRNA marker for time-of-day prediction [Gosch et al. DOI:10.1101/2025.02.03.636230]. The GABARAPL1 was removed from the CPM-normalised dataset after initial evaluation, and its coefficient was zero in the final penalised regression model using Refall-normalised data, indicating it did not contribute to the final predictive model [Gosch et al. DOI:10.1016/J.Fsigen.2025.103287].