Basic Information

Symbol
GABBR1
RNA class
mRNA
Alias
Gamma-Aminobutyric Acid Type B Receptor Subunit 1 GPRC3A Gamma-Aminobutyric Acid (GABA) B Receptor, 1 GABABR1 HGB1a Seven Transmembrane Helix Receptor GABA-B Receptor, R1 Subunit GABA-B Receptor 1 GABA-B Receptor GABA-B-R1 GABBR1-3 GABA-BR1 NEDLC GB1 Gb1
Location (GRCh38)
6:29555629-29633976
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001470.4
Sequence length
4525.0 nt
GC content
0.5580

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1727.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1808.11 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 854.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001319053.2 NCBI
CUCUCUUCCCCCCGCCCUGCCUUCCCUUGCACCCUCCUUCUUCCCUCCG… 4461 nt 0.5562
NM_001470.4 NCBI
CUCUCUUCCCCCCGCCCUGCCUUCCCUUGCACCCUCCUUCUUCCCUCCG… 4525 nt 0.5580
NM_021903.3 NCBI
AGUCAGUCCGCGAGGAGAGUCCGCGGUGGCGGCGACGGUGGCGAGAGCC… 4062 nt 0.5478
NM_021904.4 NCBI
CUCUCUUCCCCCCGCCCUGCCUUCCCUUGCACCCUCCUUCUUCCCUCCG… 4339 nt 0.5557
Summary

This gene encodes a receptor for gamma-aminobutyric acid (GABA), which is the main inhibitory neurotransmitter in the mammalian central nervous system. This receptor functions as a heterodimer with GABA(B) receptor 2. Defects in this gene may underlie brain disorders such as schizophrenia and epilepsy. Alternative splicing generates multiple transcript variants, but the full-length nature of some of these variants has not been determined. [provided by RefSeq, Jan 2016]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the GABBR1 was identified as a prefrontal cortex differential wiring gene in a transcriptomic analysis of brain reward circuitry associated with risk for methamphetamine intake [Hitzemann et al. DOI:10.3390/brainsci9070155]. In a separate study in rats, the GABBR1 was identified as an orthologous gene associated with inflammatory processes in a single-cell transcriptomic analysis of radiation-induced lung injury [Shi et al. DOI:10.17305/bb.2024.10357].