Basic Information

Symbol
GABPB2
RNA class
mRNA
Alias
GA Binding Protein Transcription Factor Subunit Beta 2 GA Binding Protein Transcription Factor Beta Subunit 2 GA-Binding Protein Subunit Beta-2 GABP Subunit Beta-2 MGC29891 GABPB-2
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_144618.3
Sequence length
8807.0 nt
GC content
0.4482

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3549.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: 100000.00 kcal/mol
Frequency: inf
Diversity: 0.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((((((((((((((((......)).))))(((((((...)))))))....((((((((((((..((((((...........))))))....(((.(((.........(((((((.((((((....(((.(((.(..(((....))).).))).))).))))))((((.(((((((.....(((((((((((.......((((((...)))))).........))))).(((((...((((...(((..(((..(((((....)))))..)))..)))...))))...)))))....)))))).............(((........))).(((((..((((((......(((((.((((((((((..((((((((..((((((..(((....)))(.((((((((.((((((...)).).))))).))).))).).))))))))))))..((((((...((((....((((.(.((.((((.......))))..))).))))..))))..))))))........((((((.((.(((..(((((((((.....(((((.((....))..)))))..)))))))))...))))).))))))..(((((((....((((.((((..(((((((..(.(((....))).).....))))))).))))..))))..)))))))...))...)))))...))))))))))))))))..))))).....))))))).))))((((((((((...))))))))...))...)))))))................(((...)))))).)))(((((((..((((((.......................))))))((.......))(((....))))))))))..((((((((.....((.((((((..(((.(((.(((((((((((.....(((((((((......(((((....))))).(((((....((((((..(((((.((((((((((((((..........))))))...)))))))).)....))))..........((....)).(((....)))..(((((..(((((....)))))))))).(((((.((.(.....).)).)))))....((((((((......))))))))...((((.((..((.((((.(((((.((......((((((...(((..((((((((((((..(((((.((((((..((((((((.((((....(((((((((((((((((.((((((((...(((........((((...((..........)).)))).........(((..((..((......)).))..)))..((((..(((....)))...)))).)))...))))))))((((((((((..........)))).))))))...))))))))))))....(((((((((.(((.((((((.(((((((((((....(((.((((((((((...(((((((......(((((..((...(((..((((.......)))))))...))(((((((.((((..(((((((((((..((((..........)))))))))........(((.((((((((.....(((..(((.((((....))))..))).)))....)))))))).)))((((...(((.(((((..((...)).))))).)))..))))...(((((((((....)))))))))((((...(((((.............))))).))))......(((((((.......)))))))..)))))))))).))))))).......................((((((((((..............(((.......))).((((((((......)))))))).............(((((((((...((.((((.........)))).))..))))).))))(.(((((.....))))).)...))))))))))..(((((((.((((((((...((.......(((..(((((...((((......))))....(((((((((...((((((..(((((.........(((((((((((((((((((.(((((((..(((((((((.((((((.(((..(((((((((((((.((((((((((((......(((((((((((((((((((((((((((((((((..(((((.....((((((((((....(((((....)))))....(((((((((((((.((.....)).))))))...).))))))((((((...((...))...))))))...)))))))))).....)))))..((((((....)))))).......(((((.....((((((.(((((((.((.......)).))))))).((((((....)))))).....................((((....))))..)))))))))))..)))))))))))))))))))).((((((.....)))))))))))))))))))......)))))))))))).)))))))))))))..)))..)))))).)))))))))..))))))).)))))))))))))))))))..((((..((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((.(((.(((((((((((((((...........(((((((((...((((......))))....................))))))))).((....))...(((((((..((...((.(((...))))).)).)))))))((((....))))..(((.((.((((((.(((((((((.(((((((...(((((((.((((((((((((((((((((.....((...(((...)))((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((.((((.((.((((((((((...........................................(((((((((((((.(((((((....((((((....)))))).....)))))))......(((((((.((((((((.(((((((((.(((((.(((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((..((.((.((((((.......(((..((((((..((..(((....((....))....))).))..))))))..))).(((((......(((((.(((((.((((.(((................(((((..(((((((.....(((((((..((((((....))))))......(((((((..(((((..(((((((.(((...)))...)))))))...)))))...)))).)))...............(((((....))))))))))))((((((.((((........))))(..((((((((.((..((((((...(((((((....(((..(((((((...((......)).))))))))))..))))))).....))))))..))))))))))..)...................((((((((..((..(((....)))..))..))))))))(((((....)))))....(((..((((((...((((((....((.(((.((((((.(((.....)))..)))))))))))..))))))......))))))..))).............(((((.(((........))).))))).(((.................)))...))))))(((((....))))))))))))...))))).......(((((....)))))((((((.(((((((..((((.........)).)).)))))))))))))........))))))))))))..))))).)))))................(((((.....))))).)))))).)).))..)))))))))))))))))))))))))))))))).)))).))))))))))))))))))).))))))))))))))).))))).))))))))).)))))))).)))))))((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((.((.(((((.(.(((((((((.((.(((((((((((.((((((.((.(((((((((((..((((((((((.((((((((((((((((.(((((((.(((((((((((((((((((((.((.((((.(((((...(((((.((((....)))).)))))......(((((......))))).....(((((.....)))))((((.(((.((((((((.(((...)))..)))))))).))).))))..((((((..........((((((..(((((((((.((..((((((((.....(((((((..(((.......)))......))))))).....((((....))))))))).))).....)))))))))))..))))))))))))(((((.....((((...((((((((((.(((((((.....((((((.(((.....................(((((((((((((...))))))).......)))))).......((((((((.((((((((((((((((((((((((.((((.((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((.(.((.((((((((..(((((((((((((((((((((..(((((((((.((((((((((((((((((((.((.((((..(((((((((((((((((((((((..(((((((((((((((..(((((((.((((((((((((((((((((((.(((((((((((((.((((((((((.((((.((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((.(((.....((((((....(((((.(((..(((((.........(((((.......))))).......(((((((..((((((((((...((((..(((.(((((((....))))))).)))..)))).(((((((((((((((.......(((((((((((((.............(((((((((.........)))).....((((((((........((((((((.((((((.(((((((.......)))).))).)))))).)))..))))).))))))))...((((((((((..((((...((.((.((((...)))).)).)).....)))))))))))))).((.(((((......))))).)).......)))))..((((((.(((........)))))))))......)))))))).)))))......)))))))).........(((((...)))))(((((.(((((((((((((.(((((((((.......)))))))))....(((((((...((((((..(((....)))..)))))).)))))))..(.(((......))).).)))))).))))))).))))))))))))........(((((.(((((.(((((..((((((.((((((.................(((((..(((((((((((......(((...(((((.((((((.((.((((((..((((.(((((.(((((....))))).............((((((((((((((.......(((((((((.((.....)))))....((((((((..(((...((((..((.((((.((((.(((.(((..((((((.........(((((((...((((........))))...)))..))))......))))))))).))).)))(((.((((((..(((((....))))).......((((((((....((((.(((((.............))))).)))).....................))))))))(((((......(((((..(((((.....))))).)))))..))))))))))))))).)))).)).))))...)))..))))))))))))))))))))))))))))............))))).))))..))...)))).)).))))))..)))))))))))))...))))))..))))).....((((((..((......))))))))....)))))).))))))..)))))))))).)))))...................(((((.....))))))))))))))).....)))))))......((((((((((((((((.......(((((((...))))))).......)))))))).)))).))))...)))))..))).))))).....)))))).......))).))))).)))))))))))))))))))))))))))))))).)))).)))))))))).))))))))))))).)))))))))))))))))))))).)))))))..))))))))))))))).))))))).))))))))))))))))..)))).)).)))))))))))))))))))).)))))))))..)))))))))))))))))))))..)))))))).)).).))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))).......)))))))))).))))))))))).(((((((..(((....)))..)))))))))))).)))))(((((...)))))..))))))))))....))))))))))))))))).))))))).)))))))))))))))).))))))))))))))))))))).)).)))))).))))))))))).)).))))))))).).))))).)).)))))..)))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..((...((((((.((....(.((((((((.((.......))..)))))))))...)).))))))..))....((((((...))))))......................................))))).(((((.......)))))))))))))...((((((....))))))(((((((((..(((..(((((...(((...))).....)))))..))).)))))....................(((((..((((((......)))))).))))).......................))))((((......))))...((((((((((((((((((((((((((((((((((....(((..........)))))))))))))))))))).)))))))))))))))))..)))))))))).)).))))..))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))..))..)))))))))))))))))))).)))))))...))))))).))))))))).)))))).)).)))))))))))))))))).))).)))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))..))))................)))))..))))..))...))))....)))))..(((((..(.((.(((.............))))).)..))))))))))....))).......))...)))))))).))))))).((((((.((((..((((......((((........(((((((((.....))))))))).(((((..((....(((....)))...)).....)))))..........))))......))))..))))))))))..)))))))))))).....(((.((((.....)))).)))(((..((((((((........))))))))..))).............................)))))...)))))))).......))))))))))).)))))).(((((((.......)))))))....((((((.((.((((((((...))).))))))).))))))((.((((....)))).))...))).))))))))).........)))))....))))..)))).)))))))).)).)))))((((....(((((.(((.(((.................))).))).))))))))))))))....)))))))..)))((.((((.......(((.......))).......)))).))...)))))).((((((((.(((((.(((............)))...)))))))))))))...(((((((((.....))))).)))))).))))))))))).))..)))).)))))).)))))))))))))).....)).))))))).))..))).)))...)))))).))))))))))((((.(((((((((((((.((((.(((.((((((((((((((.((((((......))).))))).))))...))))))))((((((........)))))))))...)))).))).)))).)))))).)))).)))))))))))).(((......((((((((((..((((......)))).)))))))))).....))).....(((((.......))))).....)))))))))).)........

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GCCAUUUUGUUGCCUCUGUUUCUCCACGAGGGGGGGUUAAAGGCCCCCA… 2760 nt 0.4551
GCCAUUUUGUUGCCUCUGUUUCUCCACGAGGGGGGGUUAAAGGCCCCCA… 8573 nt 0.4444
GCCAUUUUGUUGCCUCUGUUUCUCCACGAGGGGGGGUUAAAGGCCCCCA… 8839 nt 0.4478
GCCAUUUUGUUGCCUCUGUUUCUCCACGAGGGGGGGUUAAAGGCCCCCA… 8693 nt 0.4469
GCCAUUUUGUUGCCUCUGUUUCUCCACGAGGGGGGGUUAAAGGCCCCCA… 8855 nt 0.4475
GCCAUUUUGUUGCCUCUGUUUCUCCACGAGGGGGGGUUAAAGGCCCCCA… 2646 nt 0.4512
GCCAUUUUGUUGCCUCUGUUUCUCCACGAGGGGGGGUUAAAGGCCCCCA… 8644 nt 0.4464
GCCAUUUUGUUGCCUCUGUUUCUCCACGAGGGGGGGUUAAAGGCCCCCA… 8639 nt 0.4463
GCCAUUUUGUUGCCUCUGUUUCUCCACGAGGGGGGGUUAAAGGCCCCCA… 8807 nt 0.4482
Summary

Enables transcription cis-regulatory region binding activity. Acts upstream of or within positive regulation of transcription by RNA polymerase II. Located in nucleus. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.