Basic Information

Symbol
GABRA5
RNA class
mRNA
Alias
Gamma-Aminobutyric Acid Type A Receptor Subunit Alpha5 Gamma-Aminobutyric Acid (GABA) A Receptor, Alpha 5 Gamma-Aminobutyric Acid Receptor Subunit Alpha-5 GABA(A) Receptor Subunit Alpha-5 GABAAR Subunit Alpha-5 Gamma-Aminobutyric Acid Type A Receptor Alpha5 Subunit GABA(A) Receptor, Alpha 5 EIEE79 DEE79
Location (GRCh38)
15:26866911-26949208
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000810.4
Sequence length
2553.0 nt
GC content
0.4508

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-727.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -775.84 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 467.53
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000810.4 NCBI
GCAGAGGGCCGAUCCUCCAGCCCAGAGACGACAUGUGGCGCUCGGGCGA… 2553 nt 0.4508
NM_001165037.2 NCBI
AGAAGCGCCUAAGAGAUGCGCAUGUAAGGGGUGCCAUGGAGCACCCGGG… 3169 nt 0.5049
Summary

GABA is the major inhibitory neurotransmitter in the mammalian brain where it acts at GABA-A receptors, which are ligand-gated chloride channels. Chloride conductance of these channels can be modulated by agents such as benzodiazepines that bind to the GABA-A receptor. At least 16 distinct subunits of GABA-A receptors have been identified. Transcript variants utilizing three different alternative non-coding first exons have been described. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human post-mortem brain tissue demonstrated that the GABRA5 mRNA was significantly increased (1.7-fold) in the hippocampal dentate gyrus of individuals with alcohol dependence compared to controls, with no changes detected in the orbitofrontal or dorsolateral prefrontal cortex [Jin et al. DOI:10.3389/Fncel.2011.00030].