Basic Information

Symbol
GABRB1
RNA class
mRNA
Alias
Gamma-Aminobutyric Acid Type A Receptor Subunit Beta1 Gamma-Aminobutyric Acid (GABA) A Receptor, Beta 1 Gamma-Aminobutyric Acid Receptor Subunit Beta-1 GABAAR Subunit Beta-1 Gamma-Aminobutyric Acid Type A Receptor Beta1 Subunit GABA(A) Receptor Subunit Beta-1 GABA(A) Receptor, Beta 1 EIEE45 DEE45
Location (GRCh38)
4:46993723-47426447
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000812.4
Sequence length
1939.0 nt
GC content
0.4502

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-544.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -583.93 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 346.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000812.4 NCBI
AUUCGGGAAUUACUGCCCAGCAGCCGACUAAGUUGCAUUCCUUGAAUCU… 1939 nt 0.4502
Summary

The gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor is a multisubunit chloride channel that mediates the fastest inhibitory synaptic transmission in the central nervous system. This gene encodes GABA A receptor, beta 1 subunit. It is mapped to chromosome 4p12 in a cluster comprised of genes encoding alpha 4, alpha 2 and gamma 1 subunits of the GABA A receptor. Alteration of this gene is implicated in the pathogenetics of schizophrenia. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice selectively bred for high or low methamphetamine intake identified the GABRB1 as a differentially wired gene in the prefrontal cortex, indicating its transcriptomic association with innate risk for addiction in this brain region [Hitzemann et al. DOI:10.3390/brainsci9070155].