Basic Information

Symbol
GABRB2
RNA class
mRNA
Alias
Gamma-Aminobutyric Acid Type A Receptor Subunit Beta2 Gamma-Aminobutyric Acid Receptor Subunit Beta-2 GABA(A) Receptor Subunit Beta-2 GABAAR Subunit Beta-2 Gamma-Aminobutyric Acid Type A Receptor Beta2 Subunit Gamma-Aminobutyric Acid (GABA) A Receptor, Beta 2 Gamma-Aminobutyric Acid A Receptor Beta 2 GABA(A) Receptor, Beta 2 DEE92 ICEE2
Location (GRCh38)
5:161288429-161549044
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001371727.1
Sequence length
7266.0 nt
GC content
0.3677

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1739.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1876.46 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2237.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000813.3 NCBI
AGUUCCAAGAUAAACUCAGGAGUACCCGGAGAGCCGCUGGUGUGGACUC… 7568 nt 0.3824
NM_001371727.1 NCBI
ACAUUAGAAUUACUGCACUGGGCAGACUAAGUUGGAUCUCCUCUCUUCA… 7266 nt 0.3677
NM_021911.3 NCBI
AGUUCCAAGAUAAACUCAGGAGUACCCGGAGAGCCGCUGGUGUGGACUC… 7682 nt 0.3826
Summary

The gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor is a multisubunit chloride channel that mediates the fastest inhibitory synaptic transmission in the central nervous system. This gene encodes GABA A receptor, beta 2 subunit. It is mapped to chromosome 5q34 in a cluster comprised of genes encoding alpha 1 and gamma 2 subunits of the GABA A receptor. Alternative splicing of this gene generates 2 transcript variants, differing by a 114 bp insertion. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans identified the GABRB2 as a hub gene within a robust, validated gene coexpression network (the "blue" network) associated with cocaine use disorder in dorsolateral prefrontal cortex neurons, where it is implicated in GABAergic signaling [Huggett et al. DOI:10.1523/Jneurosci.2879-19.2020].