Basic Information

Symbol
GABRB3
RNA class
mRNA
Alias
Gamma-Aminobutyric Acid Type A Receptor Subunit Beta3 Gamma-Aminobutyric Acid (GABA) A Receptor, Beta 3 Gamma-Aminobutyric Acid Receptor Subunit Beta-3 GABAAR Subunit Beta-3 Gamma-Aminobutyric Acid Type A Receptor Subunit Beta 3 Gamma-Aminobutyric Acid Type A Receptor Beta3 Subunit Gamma-Aminobutyric Acid A Receptor Beta 3 GABA-Alpha Receptor Beta-2 Subunit GABA(A) Receptor Subunit Beta-3 GABAA Receptor Beta-3 Subunit GABA(A) Receptor, Beta 3 EIEE43 DEE43 ECA5
Location (GRCh38)
15:26543552-26939539
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000814.6
Sequence length
5767.0 nt
GC content
0.4184

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1614.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1724.05 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1718.14
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000814.6 NCBI
AGCGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCAGCAGCAGGAGCAGCCCCGGCUG… 5767 nt 0.4184
NM_001191320.2 NCBI
AGAGCUGGGCUGUUACUGGAUAUAUGCCAUGUGAGCUGGAUGGCCUGUG… 5575 nt 0.4027
NM_001191321.3 NCBI
AGUCACAACUUCCGGUUAGCGUGGCGGAGGCUCUCGGAGUCUUUGGGAC… 5537 nt 0.4062
NM_001278631.2 NCBI
AGCGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCAGCAGCAGGAGCAGCCCCGGCUG… 5863 nt 0.4184
NM_021912.5 NCBI
AGAGCGGAUCCCAGCAGGUUAGGCCGGAGGAACAGCGCCAUGUGCUCCG… 5702 nt 0.4121
Summary

This gene encodes a member of the ligand-gated ionic channel family. The encoded protein is one the subunits of a multi-subunit chloride channel that serves as the receptor for gamma-aminobutyric acid, a major inhibitory neurotransmitter of the mammalian nervous system. This gene is located on the long arm of chromosome 15 in a cluster with two other genes encoding related subunits of the family. This gene may be associated with the pathogenesis of several disorders including Angelman syndrome, Prader-Willi syndrome, nonsyndromic orofacial clefts, epilepsy and autism. Alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been described. [provided by RefSeq, Jul 2013]

Forensic Context

A study in human post-mortem brain samples found no significant change in the expression of the GABRB3 mRNA in the hippocampal dentate gyrus, orbitofrontal cortex, or dorsolateral prefrontal cortex of individuals with chronic alcohol dependence compared to controls [Jin et al. DOI:10.3389/Fncel.2011.00030].