Basic Information

Symbol
GABRG3
RNA class
mRNA
Alias
Gamma-Aminobutyric Acid Type A Receptor Subunit Gamma3 Gamma-Aminobutyric Acid (GABA) A Receptor, Gamma 3 Gamma-Aminobutyric Acid Receptor Subunit Gamma-3 GABA(A) Receptor Subunit Gamma-3 GABA(G) Receptor, Gamma 3 GABAAR Subunit Gamma-3 Gamma-Aminobutyric Acid Type A Receptor Gamma3 Subunit
Location (GRCh38)
15:26971181-27541984
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis Sudden death from CNS diseases Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_033223.5
Sequence length
10862.0 nt
GC content
0.4393

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3234.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3440.33 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 3202.81
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001270873.2 NCBI
GCACAGCGCACACAGCCCCGGCCUGGGCACCCGCGCCCGCUCGCGGCUC… 1617 nt 0.4898
NM_033223.5 NCBI
GCACAGCGCACACAGCCCCGGCCUGGGCACCCGCGCCCGCUCGCGGCUC… 10862 nt 0.4393
Summary

This gene encodes a gamma-aminobutyric acid (GABA) receptor. GABA is the major inhibitory neurotransmitter in the mammalian brain where it acts at GABA-A receptors, which are ligand-gated chloride channels. Chloride conductance of these channels can be modulated by agents such as benzodiazepines that bind to the GABA-A receptor. GABA-A receptors are pentameric, consisting of proteins from several subunit classes: alpha, beta, gamma, delta and rho. The protein encoded by this gene is a gamma subunit, which contains the benzodiazepine binding site. Two transcript variants encoding distinct isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2012]

Forensic Context

A study in human post-mortem brain tissue demonstrated that the GABRG3 mRNA showed no significant change in expression in the hippocampal dentate gyrus, orbitofrontal cortex, or dorsolateral prefrontal cortex of individuals with chronic alcohol dependence compared to controls [Jin et al. DOI:10.3389/Fncel.2011.00030].