Basic Information

Symbol
GABRP
RNA class
mRNA
Alias
Gamma-Aminobutyric Acid Type A Receptor Subunit Pi Gamma-Aminobutyric Acid (GABA) A Receptor, Pi Gamma-Aminobutyric Acid Receptor Subunit Pi GABA(A) Receptor Subunit Pi GABA(A) Receptor, Pi GABAAR Subunit Pi Gamma-Aminobutyric Acid Type A Receptor Pi Subunit
Location (GRCh38)
5:170763350-170814047
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Forensic psychiatry evaluation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014211.3
Sequence length
3304.0 nt
GC content
0.4307

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-930.97 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -992.25 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 686.38
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001291985.2 NCBI
ACUCCAUCUGAGGGUGGCUGCGUGUCCACAUACGAGGGGACAGGGCUGA… 3116 nt 0.4265
NM_014211.3 NCBI
ACUCCAUCUGAGGGUGGCUGCGUGUCCACAUACGAGGGGACAGGGCUGA… 3304 nt 0.4307
Summary

The gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor is a multisubunit chloride channel that mediates the fastest inhibitory synaptic transmission in the central nervous system. The subunit encoded by this gene is expressed in several non-neuronal tissues including the uterus and ovaries. This subunit can assemble with known GABA A receptor subunits, and the presence of this subunit alters the sensitivity of recombinant receptors to modulatory agents such as pregnanolone. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, May 2014]

Forensic Context

A study in human post-mortem brain samples found that the GABRP mRNA was not detected in the hippocampal dentate gyrus, orbitofrontal cortex, or dorsolateral prefrontal cortex of either control subjects or individuals with chronic alcohol dependence [Jin et al. DOI:10.3389/Fncel.2011.00030].