Basic Information

Symbol
GABRQ
RNA class
mRNA
Alias
Gamma-Aminobutyric Acid Type A Receptor Subunit Theta Gamma-Aminobutyric Acid Receptor Subunit Theta GABA(A) Receptor Subunit Theta GABAAR Subunit Theta Gamma-Aminobutyric Acid Type A Receptor Theta Subunit Gamma-Aminobutyric Acid (GABA) A Receptor, Theta Gamma-Aminobutyric Acid (GABA) Receptor, Theta GABA(A) Receptor, Theta THETA
Location (GRCh38)
X:152637895-152657542
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018558.4
Sequence length
6468.0 nt
GC content
0.4907

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2177.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2296.14 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1477.96
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_018558.4 NCBI
AGUCGCAGCCAGGAGCGGCCGCAGACGGAGCGCACCUCGCAGCUGCCGG… 6468 nt 0.4907
Summary

The gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor is a multisubunit chloride channel that mediates the fastest inhibitory synaptic transmission in the central nervous system. This gene encodes the theta subunit of the GABA A receptor. The gene is mapped to chromosome Xq28 in a cluster of genes including those that encode the alpha 3 and epsilon subunits of the GABA A receptor. [provided by RefSeq, Jul 2017]

Forensic Context

A study in human post-mortem brain samples demonstrated that the GABRQ mRNA showed no significant change in expression in the hippocampal dentate gyrus, orbitofrontal cortex, or dorsolateral prefrontal cortex of individuals with chronic alcohol dependence compared to controls [Jin et al. DOI:10.3389/Fncel.2011.00030].