Basic Information

Symbol
GABRR1
RNA class
mRNA
Alias
Gamma-Aminobutyric Acid Type A Receptor Subunit Rho1 Gamma-Aminobutyric Acid (GABA) Receptor, Rho 1 Gamma-Aminobutyric Acid Receptor Subunit Rho-1 GABA(A) Receptor Subunit Rho-1 GABA(A) Receptor, Rho 1 GABAAR Subunit Rho-1 GABA(C) Receptor BA135P14.1 (Gamma-Aminobutyric Acid (GABA) Receptor, Rho 1) Gamma-Aminobutyric Acid Type A Receptor Rho1 Subunit Gamma-Aminobutyric Acid (GABA) A Receptor, Rho-1
Location (GRCh38)
6:89177504-89231278
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002042.5
Sequence length
2742.0 nt
GC content
0.4468

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-741.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -794.91 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 862.38
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001256703.1 NCBI
UAAUAAUGGCCGUAAGCUUAAAAUAGAUCCAGGGAGGAGCUCAUUAACG… 3123 nt 0.4352
NM_001256704.1 NCBI
UAAUAAUGGCCGUAAGCUUAAAAUAGAUCCAGGGAGGAGCUCAUUAACG… 3276 nt 0.4368
NM_001267582.2 NCBI
AGGGAGGAGCCAAGAUGGCCGAAUAGGAACAGCUCCCGUCUACAGCUCC… 2931 nt 0.4548
NM_002042.5 NCBI
CUGUUUCUGGAGAGAGCUGUUUGAAUUUGGAAACCCAUGUUGGCUGUCC… 2742 nt 0.4468
Summary

GABA is the major inhibitory neurotransmitter in the mammalian brain where it acts at GABA receptors, which are ligand-gated chloride channels. GABRR1 is a member of the rho subunit family. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Feb 2012]

Forensic Context

A study in human postmortem brain tissue found that the GABRR1 was not detected in the hippocampal dentate gyrus, orbitofrontal cortex, or dorsolateral prefrontal cortex of either control subjects or individuals with chronic alcohol dependence [Jin et al. DOI:10.3389/Fncel.2011.00030].