Basic Information

Symbol
GABRR3
RNA class
mRNA
Alias
Gamma-Aminobutyric Acid Type A Receptor Subunit Rho3 Gamma-Aminobutyric Acid Receptor Subunit Rho-3 GABA(A) Receptor Subunit Rho-3 GABAAR Subunit Rho-3 GABA(C) Receptor Gamma-Aminobutyric Acid Type A Receptor Subunit Rho3 (Gene/Pseudogene) Gamma-Aminobutyric Acid Type A Receptor Rho3 Subunit Gamma-Aminobutyric Acid (GABA) A Receptor, Rho 3 Gamma-Aminobutyric Acid (GABA) Receptor, Rho 3 GABA(A) Receptor, Rho 3
Location (GRCh38)
3:97985102-98035315
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001105580.3
Sequence length
3113.0 nt
GC content
0.4012

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-841.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -903.91 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 882.19
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001105580.3 NCBI
GCUGAGGGUUUACUGAGUAUGGAUUGAGCAUCACACUAAAAACCUUCCC… 3113 nt 0.4012
Summary

The neurotransmitter gamma-aminobutyric acid (GABA) functions in the central nervous system to regulate synaptic transmission of neurons. This gene encodes one of three related subunits, which combine as homo- or hetero-pentamers to form GABA(C) receptors. In humans, some individuals contain a single-base polymorphism (dbSNP rs832032) that is predicted to inactivate the gene product. [provided by RefSeq, Jan 2012]

Forensic Context

A study in human post-mortem brain samples found that the GABRR3 was not detected in the hippocampal dentate gyrus, orbitofrontal cortex, or dorsolateral prefrontal cortex of either control subjects or individuals with chronic alcohol dependence [Jin et al. DOI:10.3389/Fncel.2011.00030].