Basic Information

Symbol
GALNT14
RNA class
mRNA
Alias
Polypeptide N-Acetylgalactosaminyltransferase 14 Polypeptide GalNAc Transferase 14 GalNac-T10 GalNac-T14 UDP-N-Acetyl-Alpha-D-Galactosamine:Polypeptide N-Acetylgalactosaminyltransferase 14 (GalNAc-T14) UDP-GalNAc:Polypeptide N-Acetylgalactosaminyltransferase 14 Protein-UDP Acetylgalactosaminyltransferase 14 Pp-GaNTase 14 EC 2.4.1.41 FLJ12691 UDP-GalNAc:Polypeptide N-Acetylgalactosaminyltransferase T10 Polypeptide N-Acetylgalactosaminyltransferase 15 GalNAc-T14 GALNT15
Location (GRCh38)
2:30910467-31155202
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_024572.4
Sequence length
2447.0 nt
GC content
0.5705

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-949.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -991.65 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 672.29
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001253826.2 NCBI
GUUUCCCUAUCGGCGGCAGCGGGCAAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCAG… 2462 nt 0.5654
NM_001253827.2 NCBI
AGAUUCCUUGAUGGCCACUGAAAAAUUAGCUGGUGCCUGUAUUUCAGGC… 2513 nt 0.5205
NM_001329095.2 NCBI
GUUUCCCUAUCGGCGGCAGCGGGCAAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCAG… 2580 nt 0.5682
NM_001329096.2 NCBI
GUUUCCCUAUCGGCGGCAGCGGGCAAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCAG… 2632 nt 0.5665
NM_001329097.2 NCBI
GUUUCCCUAUCGGCGGCAGCGGGCAAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCAG… 2218 nt 0.5766
NM_024572.4 NCBI
GUUUCCCUAUCGGCGGCAGCGGGCAAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCAG… 2447 nt 0.5705
Summary

This gene encodes a Golgi protein which is a member of the polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase (ppGalNAc-Ts) protein family. These enzymes catalyze the transfer of N-acetyl-D-galactosamine (GalNAc) to the hydroxyl groups on serines and threonines in target peptides. The encoded protein has been shown to transfer GalNAc to large proteins like mucins. Alterations in this gene may play a role in cancer progression and response to chemotherapy. [provided by RefSeq, Jun 2016] CIViC Summary for GALNT14 Gene

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the gene GALNT14 was differentially expressed in peripheral blood mononuclear cells from acute myocardial infarction patients, being among the top 10 differentially expressed genes when comparing samples from 1 day post-AMI versus 7 days and 1 day versus 3 months [Wang et al. DOI:10.1038/s41598-024-60945-3]. A study in mice demonstrated that the GALNT14 (Galnt15) is dysregulated after radiation exposure and was identified as a gene relevant to lung fibrosis [Aryankalayil et al. DOI:10.1080/09553002.2023.2214205].