Basic Information

Symbol
GALNT15
RNA class
mRNA
Alias
Polypeptide N-Acetylgalactosaminyltransferase 15 Pp-GalNAc-T15 GALNTL2 GALNT7 UDP-N-Acetyl-Alpha-D-Galactosamine:Polypeptide N-Acetylgalactosaminyltransferase-Like 2 UDP-N-Acetyl-Alpha-D-Galactosamine:Polypeptide N-Acetylgalactosaminyltransferase 15 UDP-GalNAc:Polypeptide N-Acetylgalactosaminyltransferase-Like Protein 2 Polypeptide N-Acetylgalactosaminyltransferase-Like Protein 2 Protein-UDP Acetylgalactosaminyltransferase-Like Protein 2 Polypeptide GalNAc Transferase-Like Protein 2 Polypeptide GalNAc Transferase 15 Pp-GaNTase-Like Protein 2 GalNAc-T-Like Protein 2 UDP-N-Acetyl-Alpha-D-Galactosamine:Polypeptide N-Acetylgalactosaminyltransferase 7 Pregnancy-Induced Hypertension Syndrome-Related Protein 5 Polypeptide N-Acetylgalactosaminyltransferase 13 UDP-GalNAc Transferase T15 EC 2.4.1.41 GALNACT15 GALNT13 PIH5
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Other applications

MANE select

Transcript ID
NM_054110.5
Sequence length
5057.0 nt
GC content
0.4783

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1678.67 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1772.13 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1140.19
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((...(((..((.((((.(((((((......)))).)))((((((...)).))))((((..........))))..)))).))..)))...)))).............(((((.............((((((((..((((.....((((((((...))))))))(((((....(((((((.((((((((............((.......))(((((((....((((((..(((((.((((......((((((((((......)))))))))))))).)))))))))))...))))))).(((((((.(((.(((...)))...))))))))))..((((((((..(((.((((((((..((((.((((((..(((((((((..((((((((((((....((((((.((..((.((((...(((((..((((((.....)))).)).)))))...)))).))..)).))))))......((.......)).....((((((((.((...(((.((((((.((((.....((((((..((.((..((((..((((((.((.(......).)).))))))....(((...)))...))))..)).))..)))))))))))))((((((((((((((...)))))).))))))))((((....))))((((((((.....((((((((((((((....(((..(((((....))))).)))))))))........((((((((((....(((.(((((..((.((((((......))))))...)).))))))))..(((((((.(((((((......)))))))(((..((..(....)..))..)))........(((.....))).(((((((((((.((.((((((((.....(((........))).....))))))))..((((((.((....))..))))))((((((...(((((.(((....((((....((((...)))))))))))))))).....)))))).)).)))).))))))).....)))))))...((((((.(((((...((....)).))))).).)))))....)))))))))).(((....)))))))))))...))))))))..((((((.((.(((((((....((((.(((..((((((((((((...((((.......))))..(((((((((...(((((((...((((((((((.(((.......((((.(((((.(((.((((((((((.((((((((.((((((((((((......(((((((.(((..((((((((.....(((....)))..))))))))..))).)).)))))((((..((((((((.((......(((((((.(((..((.(((((....((((((..(((..(((((..(((((((....)))))))))))).(((...))).((.(((.(....).))).)).)))...))))))...))))).))..))))))))))....))))))).)))..)))).))))))....)))...))).)).))))))))))))))))((((.(...((((.((((.(((((.((((((((......))))).))).(((........)))....((((((.......))))))...))))))))).)))).).)))).......))))))))...))))..((((......((((((.....)))))).....)))).......)))))))))...))))..))))((((((.....))))))..)))))))))))).))))))))))))......((((...))))...........)))))))...))))))).)).))))))))).))).)).))))))))...)))))))))......)))..)))))))))..)...))))))))).....(((....))).........((((((......((.((((((.(((((.....((((....))))....))))).)))))).)).))))))(((((.(((.((.....((((((.((((....)))).))))))..))))).)))))..((((((((((((((((...))).(((((((..((((.(((((..(((((((.((.((((((((((((((((..((((((....)))))).)))))(((((..(((((((..((((..((..(((.(..(((((..((((.....))))...(((((((((((((((((....)))).))))).))))))))...(((((((.((...(((((((...............))))))).)).))))))))))))..).)))..))..).)))..)))))))...))))).))))))))......((((.........(((((((...........)))))))))))........)))))))))))).......(((((.(((.....))))))))..)))))))))..)))))))...(((((.((((((((((....(.(((((......))))))...))))).))))).)))))........))).))))))))))................((((((((..((((((...(((..(.((((........)))).)..)))..))))))..))))))))))))))))))).....)))))))))))))))))))))))..))))).....((((((((...(((((((((((.(((((((.........))))))).))))))...(((((.((((((((((.((((.....(((((..(((.....................)))...))))).)))).)))))((((((......))))))...(((((((...))))))).....)))))))))).(((....)))(((((((((.(((..(((((((..(((...((((((((((((((.((.((.(((..((..((....((((..(((......)))((((....))))....))))....))..))((.((((((((....)))))))).)).......((((.(((.....))))))).(((.......))).........))).)).))))))))))....((((((....))))))...............))))))..((((((((((((((((((((.......))))))).........(((..(((..(((((..(((((...(((..(((...(((((..(((((((..(((..((((.(((.((..(((((..((((((.....)))))))))))..))..((((....))))))).))))))).))))))).................((((((.................((((((((((.((((.....))))))....))))))))....))))))(((((...(((..((((((..(((((((..(..(((..(((((((.((((....)).)))))))))))))..)))))))....))))))..)))..)))))..............)))))...)))..)))))))).)))))..)))..)))...)))))))).))))).)))..))))))).....)))...)).))))))).)))))....))))))))..(((((((((((((..((.(((((..(((((((((.((.....((((.((.((......((((((....)).))))......)).)))))))).)))))))))..)).(((((.((..(((((.(((((((((((((.....((((.....))))((((((((..(..(((..((((((....................)))))))))..)..))))))))..((((((((..((((((.((((..((((.(((...))).))))......(((((((......))))))).......)))).))).))))).)))))).....)))))))((((((...........))))))(((((........)))))....(((......)))...(((((.(((((((((((((..(((....(((((.((.......)).)))))..(((.((........)).))))))..))))))))))).))...)))))...)))))))))))(((((((..((((((((((((((.(((...((((((((((((((((((((....))))))))))................(((((((....)))))))..)))))))))).....((.(((.........)))))))))).......))))))))))))..)))))))..(((((((...........))))))).((((((((((.....((.(((....(((((((.(((((.......((((..(((((((...(.(((((..................................))))).).))))))).))))....))))))))))).)(((((....)))))...((.((((((((((......)))))).)).)).))((((((((((((((((((...(((((((((((((((...((((..(((((((........................((((((((.....((((.....))))...((.((((........((((((((((..(((.....)))...)))))).....(((((((((........))))))))))))).(((((((............(((((......)))))(((((......)))))...))))))).(((((...............))))).....)))).))))))))))...((((((.....))))))..((.(((.....))))).......(((........))))))))))))))....)))))))))).)))))...)))))...........))))))))))))).))).)).....))))))))))......)).))))).....))).)).))))))))..)))))........))))..))))))))....))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
......((((...(((..((.((((.(((((((......))))},))((((((...))}})))((((..........))))..)))).))..)))...)))).............(((((..,{.......,.((((((((..((((.....((((((((...)))))))}(((((.{..((((((((((((((((...,,{{{{,.{((.......))|{|||||,,..((((((..(((((.((((......((((((((((......)))))))))))))).)))))))))))...|}}}}}).(((((((.(((.(((...)))...))))))))))..((((((((.,(((.((((((((..((({{((({({..(((((((((.,((((((((((((,,..((((((.((..((.((((...(((((..{{((((.....)))).}}.)))))...)))).))..)).))))))..,...((.......)).....((((((((.{(...(((.((({{({(({(,{{{,{{{{((,.((,{{.{((,{{,((((((.({,(,,,,,.|.}}.}}}}},|{,,(({,.,|||.,{}|||,,||{||,.||}},}}}},}}}((((((((((((((...)))))).)))))))).,,{...,)}}}||||{{{{,.,|||{{{{{{(||(|({..{.(((.(((((({{{{|||||{||{{,,{||{,,{{{,.(,,,{|||||....(((.(((((..((.((((((......))))))...)).))))))))..{((({{(,(((((((......))))))).||..,|.,||..}}.))),}),......{{((((..{{.,,,.||,,||||||{.{{.((((((((.,.,.(((.....,,,})}..,..))))))))..((((((.((....))..)))))),(((((...|||}},,||,,.}||||}}}}||||}.}))}}}})))))))))},,,,,)))))},)).)})),)))))))},},,)}}}}}}...{(((((.(((((...{{....}}.))))).),,))))....,}}||||,|},(((|...}}}}}}))))}...))))}))))}|(((((.((.(((((((....((((.(((..((((((((((((...((((.......)))),.(((((((({...{((((((.,,{({(((((((.(((.....,.{(((.({{(,.{{{.((((((((((.((((((((.(((({((((((,......(((((((,(((..((((((((.....(((....)))..))))))))..))).)).))))|((((..((((((((.((......(((((((.(((..((.(((((.{,,((((((..{{{..,{{{,..|||||{{....|||||||,,|||{((.....|,.,{.,|,.,..}})})),.},,))),,,))))))...))))).))..))))))))))....)))))))},))..)))),),))))),..,)}..,))).)).))))))))))))))))((((.(...((((.((((.(((((.,,{{((((......))))|,|||((({.....,,,)})),,.((((((.......))))))...))))))))).)))),,,)))).,,,,|,))}}}}})...}}}}..((((......(((((|.....,))))).....)))).......)))))))))}.,))}}..))))((((((.....))))))..}}}))))))))).))))))))))))......(((,...})))....,....},))}))))...))))))).)).)))))}))).))).}).))))))))...)))))))))......))),.))))))))).,|,..})))})))),,,|}|||,,,,}||,..{{,|.{{{({,{,{,{,,({.((((((.(((((.....((((....))))....))))).)))))).}|.}}|||},||||}|}||||,,|||(((({{.{{{{..,,)))).))))),,,)}}})}}}|||{.(((((((((((({,{{...,,|.(((((((..((({((((((,.((((({{{((.((((((((((((((((.{((((((....)))))).)))))}{,.{{{((((..((((..((.(({.(((...})).})).}),))))..))))}..(((((((((((((((((....)))).))))))}}))))))...(((((((.((...(((((((,.............,))))))).)).)))))))|||({.{{{|||{((|,...}))),))))),.}}},,}}..,))))))).{{..{(.((,...}}}.}||||{{.,,..,,,....||))|,)}.))........)))))))))))).......(((((.{{{.....})})))))..))))))))),.)))))))...(((((.(((((((({{....({(((({......)))))}...))))))))},,.)))))........))).)))))))))),.,.............((((((((..((((((.,.{((..{.((((........)))).}..))),.))))))..)))))))))))))))))))....,))))))))})))))))))))))),.))))).....((((((((...(((((((((((.(((((((.........})))))).)))))}...(((({,((((((((((.((((.....(((((..{((.....{{......}.,.....}))...))))).)))).)))))((((((......))))))...(((((({...})))))).....)))))))))).,,{....}}}(((((((({.(((..(((((((..(({...((((((((((((((.((.((.(((...,{{.,....((((,,(((,.....,)}||||,...}}}}....}}}}..,.||,{,.{,.((((((((....)))))))),)),......((((.(({.....))))))).|||,,.....}}}.........))).)).)))))))))}....((((((....,}}}},,,,,,},.......,))))))..((((((((((((((((((((,......))))))).,,,,,{{{(((,.{{{..,,,,,..|||||}}},||}}|{{...{{((({{((((,,,.}|||{((((.,((({....{((((,..,,||})}}}}))))))}})))|{{{{.((((....)))))))}},.{{||{,,,))))).....{{{,,,{((((((,,{..................{(((,((((({((((.....)))).|,..{|||||,,,.,))))),)){((({...(((..((((((..(((((((..(..(((..(((((((.((((....)).)))))))))))))..)))))))....))))))..)))..)))))..............{{({{...))))),},)))))},))))}})))}}))),..)))))))).))))).}))..))))))).....)))...)))))))))).)))))....))))))))..|{{{{((((((((..{{,(((((..(((((((((.((.....((((.((.((.,,...((((((....)).))))...,,.)).)))))))).)))))))))..)).(((({.{{..(((((.(((((((((((((.....((((.....))))((((((((..(.,(({.{((({{{............},,.....)))))))})..)..))))))))..(((((((({..(((((.((((..((((.{(,...,}}.))))......(((((({......})))))).......)))},))),,,))).)))))).....)))))))((((((,,....,,},.}}))))(((((........)))))....(((......))}...(((((.(((((((((((((..(((....(((((.{{.......,}.)))))..{((.((........)).))})))..))))))))))).))...)))))...)))))))))))(((((((..(((((((((((({{.{,....{(((((((((((((((((((....)))))))))}................(((((((....))))))).|)))))))))}.....{{.{,{.........))))}}})}},......})))))))))))..)))))))..(((((((...........))))))),{(((((((((.....((.{({...,{((((((.(((((.......((({..(((((((...{,(((((..........,,{,.....,}},...........))))).,.))))))).))))....))))))))))).}(((((....)))))...((.((((((((((......))))))},).)).)){(((((((((((((((((...(((((((((((((((...((((..(((((((....,,{,,,.,||||,,.,....,,{{{,||,|||||{{{....,)}}},},{{.(({|,,,.....{(((((((({..(((.....)))...)))))).....(((((((((........)))))))))}})}.(((((({....,.......(((((......)))))(((((......)))))...))))))).,{{{{.....,,,.....,,)}}},...,,)))).))}}}},|||{{,((((((.....)))))),}.,.|||.,,,,},,,........,{,,,,.....))})))))))))))....)))))))))).)))))...)))))...........))))))))))))}.})).)).....)))))))))},},.,,)).})})),,,,,))),)).)))))))),.))))}.....,.,))))..))))))))....))))).

Transcripts

ID Sequence Length GC content
ACAUCUGUUGAUCUGACCUGACUGGAAGCGUCCAAAGAGGGACGGCUGU… 2445 nt 0.5542
ACAUCUGUUGAUCUGACCUGACUGGAAGCGUCCAAAGAGGGACGGCUGU… 5057 nt 0.4783
Summary

Predicted to enable polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase activity. Predicted to be involved in protein O-linked glycosylation. Located in transport vesicle. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the GALNT15 mRNA, relevant to lung fibrosis, was dysregulated after radiation exposure [Aryankalayil et al. DOI:10.1080/09553002.2023.2214205].