Basic Information

Symbol
GALNT8
RNA class
mRNA
Alias
Polypeptide N-Acetylgalactosaminyltransferase 8 Polypeptide GalNAc Transferase 8 GALNAC-T8 UDP-N-Acetyl-Alpha-D-Galactosamine:Polypeptide N-Acetylgalactosaminyltransferase 8 (GalNAc-T8) Probable Polypeptide N-Acetylgalactosaminyltransferase 8 Protein-UDP Acetylgalactosaminyltransferase 8 Pp-GaNTase 8 EC 2.4.1.41 UDP-GalNAc: Polypeptide N-Acetylgalactosaminyltransferase 8 UDP-GalNAc:Polypeptide N-Acetylgalactosaminyltransferase 8 GalNAc Transferase 8 GalNAc-T8
Location (GRCh38)
12:4720267-4851927
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_017417.2
Sequence length
2321.0 nt
GC content
0.4981

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-764.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -809.05 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 472.81
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_017417.2 NCBI
GUUAUCUCCCUGAGCAACCUGUGGAAAGCCGCUGAGCAACCUGUGGAAA… 2321 nt 0.4981
Summary

This gene encodes a member of the UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase (GalNAc-T) family of enzymes. GalNAc-Ts initiate mucin-type O-linked glycosylation in the Golgi apparatus by catalyzing the transfer of GalNAc to serine and threonine residues on target proteins. They are characterized by an N-terminal transmembrane domain, a stem region, a lumenal catalytic domain containing a GT1 motif and Gal/GalNAc transferase motif, and a C-terminal ricin/lectin-like domain. GalNAc-Ts have different, but overlapping, substrate specificities and patterns of expression. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A multi-omics study in human postmortem prefrontal cortex (Brodmann Area 9) from individuals with cocaine use disorder (CUD) identified the GALNT8 as a gene that was both differentially expressed and exhibited differential alternative splicing in CUD [Zillich et al. DOI:10.1038/S41398-024-03139-9].