Basic Information

Symbol
GATA3
RNA class
mRNA
Alias
GATA Binding Protein 3 HDR Trans-Acting T-Cell-Specific Transcription Factor GATA-3 GATA-Binding Factor 3 GATA-Binding Protein 3 HDRS
Location (GRCh38)
10:8045315-8075198
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001002295.2
Sequence length
3083.0 nt
GC content
0.5371

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-987.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1039.84 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 756.73
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001002295.2 NCBI
GAACACUGAGCUGCCUGGCGCCGUCUUGAUACUUUCAGAAAGAAUGCAU… 3083 nt 0.5371
NM_002051.3 NCBI
GAACACUGAGCUGCCUGGCGCCGUCUUGAUACUUUCAGAAAGAAUGCAU… 3080 nt 0.5373
Summary

This gene encodes a protein which belongs to the GATA family of transcription factors. The protein contains two GATA-type zinc fingers and is an important regulator of T-cell development and plays an important role in endothelial cell biology. Defects in this gene are the cause of hypoparathyroidism with sensorineural deafness and renal dysplasia. [provided by RefSeq, Nov 2009] CIViC Summary for GATA3 Gene

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.