Basic Information

Symbol
GBAS
RNA class
mRNA
Alias
Nipsnap Homolog 2 GBAS Glioblastoma Amplified Sequence Protein NipSnap Homolog 2 4-Nitrophenylphosphatase Domain And Non-Neuronal SNAP25-Like 2 Glioblastoma-Amplified Sequence NipSnap2
Location (GRCh38)
7:55951793-56000181
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001483.3
Sequence length
1993.0 nt
GC content
0.4099

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-542.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -581.68 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 394.82
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary

This gene encodes a member of the NipSnap family of proteins that may be involved in vesicular transport. The encoded protein is localized to mitochondria and plays a role in oxidative phosphorylation. A pseudogene of this gene is located on the long arm of chromosome 2. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Feb 2011]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.