Basic Information

Symbol
GBP2
RNA class
mRNA
Alias
Guanylate Binding Protein 2 Guanylate Binding Protein 2, Interferon-Inducible Interferon-Induced Guanylate-Binding Protein 2 Guanine Nucleotide-Binding Protein 2 Guanylate-Binding Protein 2 GTP-Binding Protein 2 EC 3.6.5.- HuGBP-2 GBP-2
Location (GRCh38)
1:89106132-89150456
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004120.5
Sequence length
4088.0 nt
GC content
0.4200

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1114.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1198.79 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1116.21
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_004120.5 NCBI
AUAUUAGUGCAUUUCUUUGCAGAGGUUACCUCUUUUUCUUGUCUCUCGU… 4088 nt 0.4200
Summary

This gene belongs to the guanine-binding protein (GBP) family, which includes interferon-induced proteins that can bind to guanine nucleotides (GMP, GDP and GTP). The encoded protein is a GTPase which hydrolyzes GTP, predominantly to GDP. The protein may play a role as a marker of squamous cell carcinomas. [provided by RefSeq, Jul 2013]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the GBP2 (Guanylate-binding protein 2) is a gene/protein marker whose expression increased in the recovery stage of non-lethal sepsis [Zhang et al. DOI:10.1093/jimmun/vkaf140].