Basic Information

Symbol
GCN1L1
RNA class
mRNA
Alias
GCN1 Activator Of EIF2AK4 KIAA0219 GCN1L1 GCN1L GCN1 (General Control Of Amino-Acid Synthesis 1, Yeast)-Like 1 General Control Of Amino-Acid Synthesis 1-Like Protein 1 GCN1, EIF2 Alpha Kinase Activator Homolog GCN1 EIF-2-Alpha Kinase Activator Homolog Stalled Ribosome Sensor GCN1 Translational Activator GCN1 GCN1-Like Protein 1 HsGCN1 Peroxisome Proliferator Activated Receptor Interacting Complex Protein GCN1 General Control Of Amino-Acid Synthesis 1-Like 1 (Yeast) GCN1 General Control Of Amino-Acid Synthesis 1-Like 1 EIF-2-Alpha Kinase Activator GCN1 PRIC295
Location (GRCh38)
12:120127202-120194976
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006836.2
Sequence length
8681.0 nt
GC content
0.5634

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3452.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3599.43 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2783.95
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Summary

Enables several functions, including protein kinase regulator activity; stalled ribosome sensor activity; and ubiquitin-protein transferase regulator activity. Involved in protein-RNA covalent cross-linking repair. Located in cytosol. Is active in cytosolic ribosome. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.