Basic Information

Symbol
GDI1
RNA class
mRNA
Alias
GDP Dissociation Inhibitor 1 RABGDIA OPHN2 Oligophrenin-2 XAP-4 GDIL Guanosine Diphosphate Dissociation Inhibitor 1 Rab GDP-Dissociation Inhibitor, Alpha Rab GDP Dissociation Inhibitor Alpha Protein XAP-4 Rab GDI Alpha FLJ41411 MRX41 MRX48 GDI-1 Testis Secretory Sperm-Binding Protein Li 208a Mental Retardation, X-Linked 41 Mental Retardation, X-Linked 48 RABGD1A XLID41 XAP4 1A
Location (GRCh38)
X:154436600-154443467
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001493.3
Sequence length
2240.0 nt
GC content
0.5576

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-792.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -832.78 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 710.04
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001493.3 NCBI
AUCUUUGGUCCAGUGCGGUGGCGGCGGCGGCGGUGGCGGCGGCGACUGC… 2240 nt 0.5576
Summary

GDP dissociation inhibitors are proteins that regulate the GDP-GTP exchange reaction of members of the rab family, small GTP-binding proteins of the ras superfamily, that are involved in vesicular trafficking of molecules between cellular organelles. GDIs slow the rate of dissociation of GDP from rab proteins and release GDP from membrane-bound rabs. GDI1 is expressed primarily in neural and sensory tissues. Mutations in GDI1 have been linked to X-linked nonspecific cognitive disability. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the GDI1 was up-regulated in brain tissue at 8 hours (1.903-fold) and 24 hours (1.961-fold) following whole-body irradiation with 10 Gy γ-rays [Zhao et al. DOI:10.1158/1078-0432.CCR-05-2418]. This finding was validated by real-time quantitative RT-PCR, which showed 100% concurrence with the microarray data in terms of the direction of change. A study in humans demonstrated that the GDI1 mRNA was up-regulated by 34% in pericontusional brain tissue from one traumatic brain injury (TBI) patient (T4) and by 56% in another (T7) compared to control tissue, as identified through cDNA microarray analysis [Michael et al. DOI:10.1016/j.jocn.2004.11.003]. This differential expression was part of a broader finding where 104 genes showed significant changes in traumatized tissue, with genes involved in signal transduction, like the GDI1, being among the functional categories most often affected.