Basic Information

Symbol
GFPT1
RNA class
mRNA
Alias
Glutamine--Fructose-6-Phosphate Transaminase 1 GFAT1 GFAT GFPT GFA Glutamine--Fructose-6-Phosphate Aminotransferase [Isomerizing] 1 Glutamine:Fructose-6-Phosphate Amidotransferase 1 D-Fructose-6-Phosphate Amidotransferase 1 Hexosephosphate Aminotransferase 1 EC 2.6.1.16 GFAT 1 Glucosamine--Fructose-6-Phosphate Aminotransferase [Isomerizing] 1 Glutamine-Fructose-6-Phosphate Transaminase 1 CMSTA1 GFAT1m GFPT1L CMS12 MSLG
Location (GRCh38)
2:69319780-69387281
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001244710.2
Sequence length
8665.0 nt
GC content
0.3820

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2512.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2679.81 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2144.97
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001244710.2 NCBI
GAAGGCUGUCGUUGCCUUGGCCGUCGCAUCCCCGAGGGAGUCGUGUCGG… 8665 nt 0.3820
NM_002056.4 NCBI
GAAGGCUGUCGUUGCCUUGGCCGUCGCAUCCCCGAGGGAGUCGUGUCGG… 8611 nt 0.3814
Summary

This gene encodes the first and rate-limiting enzyme of the hexosamine pathway and controls the flux of glucose into the hexosamine pathway. The product of this gene catalyzes the formation of glucosamine 6-phosphate. [provided by RefSeq, Sep 2008]

Forensic Context

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