Basic Information

Symbol
ALDH1A2
RNA class
mRNA
Alias
Aldehyde Dehydrogenase 1 Family Member A2 RALDH2 Retinaldehyde-Specific Dehydrogenase Type 2 Retinal Dehydrogenase 2 EC 1.2.1.36 RALDH(II) RALDH 2 Aldehyde Dehydrogenase 1 Family, Member A2 Aldehyde Dehydrogenase Family 1 Member A2 Retinaldehyde Dehydrogenase 2 RALDH2-T EC 1.2.1 RalDH2 DIH4
Location (GRCh38)
15:57953424-58497866
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003888.4
Sequence length
3386.0 nt
GC content
0.4681

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1054.07 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1118.13 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1100.42
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001206897.2 NCBI
GGACCGCGCGCACAGCCCGCACUGCCCCACGCCGCGGGCUAGGGACACC… 3483 nt 0.4660
NM_003888.4 NCBI
GGACCGCGCGCACAGCCCGCACUGCCCCACGCCGCGGGCUAGGGACACC… 3386 nt 0.4681
NM_170696.3 NCBI
GGACCGCGCGCACAGCCCGCACUGCCCCACGCCGCGGGCUAGGGACACC… 3272 nt 0.4664
NM_170697.3 NCBI
AGUUGUGCCUCUUCCUCUCUAACAGGCAGAUAUAGACAAAGCAGUGCAG… 3128 nt 0.4562
Summary

This protein belongs to the aldehyde dehydrogenase family of proteins. The product of this gene is an enzyme that catalyzes the synthesis of retinoic acid (RA) from retinaldehyde. Retinoic acid, the active derivative of vitamin A (retinol), is a hormonal signaling molecule that functions in developing and adult tissues. The studies of a similar mouse gene suggest that this enzyme and the cytochrome CYP26A1, concurrently establish local embryonic retinoic acid levels which facilitate posterior organ development and prevent spina bifida. Four transcript variants encoding distinct isoforms have been identified for this gene. [provided by RefSeq, May 2011] CIViC Summary for ALDH1A2 Gene

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the ALDH1A2 is predominantly expressed in the atrial cardiomyocyte cluster aCM2, which is associated with the metabolic regulation of cardiomyocytes in the right atrium following myocardial infarction [Bian et al. DOI:10.3892/mmr.2025.13680].