Basic Information

Symbol
GGT1
RNA class
mRNA
Alias
Gamma-Glutamyltransferase 1 D22S672 D22S732 CD224 GGT Glutathione Hydrolase 1 Proenzyme Gamma-Glutamyltranspeptidase 1 Leukotriene-C4 Hydrolase EC 2.3.2.2 GGT 1 Testicular Tissue Protein Li 73 CD224 Antigen EC 3.4.19.13 EC 3.4.19.14 GGTD GTG
Location (GRCh38)
22:24594684-24629011
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001288833.2
Sequence length
2630.0 nt
GC content
0.6163

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1143.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1183.39 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 834.95
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001288833.2 NCBI
GUUUUGGUGUGCUGCUGGAUGACCAGACCGGGCGUCGGGUGAGCCCAGA… 2630 nt 0.6163
NM_013421.3 NCBI
GUUUUGGUGUGCUGCUGGAUGACCAGACCGGGCGUCGGGUGAGCCCAGA… 2558 nt 0.6204
NM_013430.3 NCBI
GCCUGGAUUCUCCCAGAGAUUGCCUGGAACACCAGCUCGGGUCCUCGCA… 2354 nt 0.6189
Summary

The enzyme encoded by this gene is a type I gamma - glutamyl transferase that catalyzes the transfer of the glutamyl moiety of glutathione to a variety of amino acids and dipeptide acceptors. The enzyme is composed of a heavy chain and a light chain, which are derived from a single precursor protein. It is expressed in tissues involved in absorption and secretion and may contribute to the etiology of diabetes and other metabolic disorders. Multiple alternatively spliced variants have been identified. There are a number of related genes present on chromosomes 20 and 22, and putative pseudogenes for this gene on chromosomes 2, 13, and 22. [provided by RefSeq, Jan 2014]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that whole blood gene expression profiles after chronic intermittent ethanol exposure could discriminate between ethanol-exposed and air-exposed subjects using machine learning classifiers, achieving a maximum AUC of 90.1% [Ferguson et al. DOI:10.3389/Fnmol.2022.1032362].